Data Medicine @sir_william_osler Channel on Telegram

Data Medicine

@sir_william_osler


Listen to your data, it is telling you the diagnosis.
Канал о биостатистике, эпидемиологии и политике в медицине.

Data Medicine (Russian)

Новый канал 'Data Medicine' приглашает вас в увлекательный мир биостатистики, эпидемиологии и политики в медицине. Здесь вы найдете самую актуальную информацию о том, как данные могут помочь в диагностике и лечении заболеваний.

Наш основатель, пользователь с ником 'sir_william_osler', вдохновлён словами великого врача Уильяма Ослера, который говорил: 'Слушайте свои данные, они говорят вам диагноз'. Именно поэтому мы приглашаем вас присоединиться к нашему каналу, чтобы узнать, как правильно интерпретировать данные и использовать их для улучшения нашего здоровья.

На 'Data Medicine' мы не только обсуждаем актуальные темы в области медицины, но и делимся советами и рекомендациями по анализу данных для принятия важных решений в области здравоохранения. Присоединяйтесь к нам сегодня, чтобы узнать, как данные могут стать вашим надежным помощником в борьбе за здоровье и благополучие.

Data Medicine

20 Feb, 10:21


Почему нельзя просто так делать ПЭТ с ПСМА

Или почему не стоит делать исследования “на всякий случай”.

У меня есть пациент с раком простаты низкого риска, которого я наблюдаю длительное время. Мы регулярно делаем ему МРТ и определяем уровень ПСА, чтобы вовремя заметить момент, когда лечение станет необходимым. Всё шло по плану, пока пациент не попал к гастроэнтерологу, который, изучив его историю, решил назначить ПСМА-ПЭТ, аргументировав это тем, что «этот метод хорошо видит рак простаты».

Результат вызвал панику: на снимках обнаружилось накопление ПСМА в одном из позвонков. Хотя на КТ в этой области ничего не было видно, пациента охватила тревога, что он упустил шанс на своевременное лечение, опухоль дала метастазы и стала неизлечимой.

Игнорировать находку было нельзя, поэтому мы сделали МРТ, которое подтвердило изменения в этом позвонке. Чертыхаясь, я начал организовывать биопсию под контролем КТ: поверить в метастазирование рака простаты низкого риска в единичный позвонок крайне сложно, но и закрыть на находку глаза было уже нельзя. Началось то, что мы называем каскадами обследований, когда одно ненужное обследование влечёт за собой небезопасные другие.

К счастью, обстоятельства сыграли в нашу пользу: врач, проводящий биопсию, оказался в отпуске, а затем произошла мискоммуникация, из-за чего прошло около месяца. За это время пациент самостоятельно сделал повторное МРТ, и — сюрприз! — изменений в позвонке больше не оказалось. «Артефакт», — пояснил рентгенолог.

А ведь я уже начинал думать, как объяснять, что рак простаты низкого риска с солитарным метастазом в позвонок, скорее всего, тоже может не потребовать немедленного лечения. Такие метастазы едва ли влияют на продолжительность жизни, ведь аналогичный рак без метастазов может годами обходиться без терапии и почти никогда не становится причиной смерти. При этом аккуратных научных данных, подтверждающих эту гипотезу, до сих пор нет, и во всех рекомендациях метастатический рак начинают лечиться сразу.

Главный урок: никогда не стоит делать исследование просто потому, что оно «хорошо что-то видит». Иногда оно видит то, чего на самом деле нет.

#МихаилЛасков

Data Medicine

20 Feb, 08:43


Думаю, что про гистограммы достаточно. Закрываю тему, а то в комментариях уже перешли к обсуждению оснований математики :)

Data Medicine

20 Feb, 08:25


Есть и всякие статистические алгоритмы подбора идеального числа ящиков. И функции для рисования гистограмм могут их использовать, чтобы по умолчанию выходило красиво. Но это не всегда работает.
Вот описания таких правил (их понимание требует определенной математической подготовки):
https://en.wikipedia.org/wiki/Sturges%27s_rule
https://en.wikipedia.org/wiki/Freedman%E2%80%93Diaconis_rule
https://en.wikipedia.org/wiki/Scott%27s_rule

Data Medicine

20 Feb, 08:07


Округление -- не единственный фактор, который может влиять на информативность гистограммы. Еще надо учитывать число измерений. Если их меньше, чем столбиков, гистограмма тоже станет некрасивой. Вот, например, 3 гистограммы одного набора данных из 50 измерений (без округления). Когда ящики слишком узкие, в них попадает всего по 1, 2 или 3 измерения и гистограмма "рассыпается".

Data Medicine

20 Feb, 07:59


Вот серия гистограмм фракции выброса с шириной ящика 20, 10, 5, 2,5, 1, 0,5 и 0,1. Когда ящики слишком широкие, картинка не особо информативна. Когда слишком узкие, появляются артефакты, связанные с точностью измерения (промежутки между столбиками -- это интервалы, куда никто не попал (например, между 45,3 и 45,4, просто потому что фракция выброса измеряется в целых числах). Артефакты, связанные с округлением до 5%, исчезают, если ширина ящика 5 и больше. Наверное, для этой гистограммы такой вариант оптимален (третья гистограмма). Гистограмма со стобиками меньше ширины показывает пики округления -- если это предмет исследования, то хорошо их показать, если нет -- то, наоборот, лучше скрыть, поскольку они мешают восприятию и не несут дополнительной информации.

Data Medicine

20 Feb, 07:48


Еще один интересный вопрос — это как правильно выбирать ширину ящиков/столбиков на гистограмме. Понятно, что это вопрос личных предпочтений, но есть некоторые принципы. Основной принцип — найти середину между крайностями. Если ящиков слишком мало, гистограмма будет неинформативна. Если слишком много, опять неинформативна. Сейчас покажу примеры.

Data Medicine

19 Feb, 19:02


А вот здесь по оси Y отложены проценты. Это как будто "нормальная гистограмма" с density, у которой столбцы как бы ширины 1. То есть если ширина столбцов будет 1, то percent совпадут с density. Скажем, средние два столбика содержат примерно по 15% пациентов (в сумме около 30%), четко и ясно. На мой вкус, это самая удобная для чтения гистограмма.

Data Medicine

19 Feb, 19:00


Тут немного нетрадиционный способ изобразить две гистограммы на одном графике. Вот тут у меня вопрос: иногда по оси Y отложена frequency, и можно подумать, что это то ли density, то ли проценты, но на самом деле -- это число слуаев (и это не ошибка, так всегда). Интересно, почему? Обычно frequency -- это пропорция, но на гистограммах -- это абсолютно число.
(Ответ в комментариях, спасибо Максиму Кузнецову -- имеется в виду absolute frequency, т.е. абсолютное число. Это стандартное употребление, хотя с языковой точки зрения меня немного удивляет.)

Data Medicine

19 Feb, 18:58


Тут вроде попонятнее. По оси Y -- число пациентов.

Data Medicine

19 Feb, 18:55


Вот такое. Это вообще гистограмма? Похоже, но не уверен. Ось X не линейна (похожа на логарифмическую, но это не точно), какие-то странные кусочки столбиков другого цвета прыгают туда-сюда. В общем, эээ...
(Ось Y на одной линейная, на другой логарифмическая.)

Data Medicine

19 Feb, 18:53


Приведу еще несколько гистограмм из того же журнала, чтобы показать, какие они бывают. И задам один вопрос.

Data Medicine

19 Feb, 18:48


И прошу прощения как у тех, кому все равно все осталось непонятно, так и у тех, кому это кажется неприличным упрощением и профанацией. Я старался 🙂

Data Medicine

09 Feb, 16:25


В комментариях подсказывают, что это связано с тем, что при анализе не учитывается фактор риска, который был принудительно (а не независимо и случайно) равномерно распределен между группами, а p-value расситывается так, как будто это независимые одинаково распределенные случайные величины. Если учесть фактор риска при анализе (с помощью регрессии), то все становится на свои места.
В целом, общий вывод, что важнее учитывать факторы риска (ковариаты) при анализе, чем стратифицировать при рандомизации (см. подробности в чате комменатриев). Но конверты перемешивать я уже не буду.

Data Medicine

09 Feb, 15:05


А вот так при неэффективном вмешательстве и стратификации по фактору риска исхода:

Data Medicine

09 Feb, 15:05


И действительно, вот так распределены p-values при обычной рандомизации (и неэффективном вмешательстве)

Data Medicine

09 Feb, 15:04


В связи с этим обсуждением у меня возник такой вопрос. А что значит более эффективное исследование? Ниже ошибка первого рода или ниже ошибка второго рода?
Попробовал посимулировать. Выходит, что и та, и другая. Но из этого следует немного парадоксальный вывод, что при условии, что вмешательство неэффективно (нулевая гипотеза верна), будет меньше статистически достоверных результатов (p < 0.05). Меньше, чем что? Выходит, что меньше, чем 5%. Это странновато и из этого следует, что при отсутствии эффекта от вмешательства при стратифицированной по фактору риска рандомизации p-values будут распределены неуниформно.
Для меня это контринтуитивный результат, но он подтверждается симуляцией.

Data Medicine

09 Feb, 13:10


Поэтому я сделал "маску", предотвращающую просвечивание. (На видео и фотографии -- пробный образец, в исследование пойдет другая последовательность.)

Data Medicine

09 Feb, 13:08


Конечно, есть и другие способы нарушить консилмент (сокрытие). Можно просто подсмотреть в конверт, подделать документы, подкупить того, кто делал конверты. Тут недавно писали в комментариях, что биостатистики зарабатывают миллионы, интересно, можно ли заработать миллион на рандомизации? Не знаю, устю ли я, если мне предложат миллион за содержимое конвертов. В общем, против лома нет приема. Но простые вещи следует предусмотреть. Конверты должны быть запечатаны, изготавливать их должен кто-то не имеющий прямого влияния на решение о включении в исследование и т. д.
Я сделал еще одну маленькую хитрость. Я спросил себя, чтобы я сделал, если бы хотел узнать, в какую группу попадет следующий участник? Ну конечно я бы посмотрел конверт на свет. Я проверил, бумага плотная, крафтовая, но над яркой лампой прочесть можно.

Data Medicine

09 Feb, 13:02


Как же запутать исследователя, если используется блочная рандомизация? Можно не говорить ему, какой длины блоки используются. Но если он хитрый, он посмотрит на первые результаты рандомизации и бытро вычислит. А можно делать блоки разной длины и выбирать эту длину случайно. Именно так мы и сделали в наших конвертах: мы использовали блоки длины 4, 6 и 8 (с вероятностью обратно пропорциональной длину блока). Т.е. в каждый момент равна вероятность того, что пациент идет в блоке длиной 4, 6 и 8. Это все равно оставляет небольшую свободу угадывания, но делает такое угадывание намного менее точным, даже если исследователь очень хитер.

Data Medicine

09 Feb, 12:58


Зачем вообще скрывать, в какую группу попадет следующий пациент, и от кого? В первую очередь от исследователей, но и от пациента тоже. Если исследователь неравнодушен и у него есть представления о пользе вмешательства или предпочтения в отношении результатов исследования, то он может хитрить с включением в исследование. Например, взять следующий конверт, если знает, что в ближайшем -- контроль, а он хочет вмешательство. Или вовсе не включить паицента в исследование, потому что этому пациенту он хотел бы не делать вмешательство, а ему известно, что следующему участнику будут его делать "по рандомизации".

Data Medicine

09 Feb, 12:53


Блочная рандомизация гарантирует, что дисбаланс не превысит величину блока. Но у нее есть один минус, связанный с "консилментом" -- сокрытием результата рандомизации от исследователей. При обычной рандомизации никто не зает, что выпадет следующим: контроль или вмешательство. Но если монеточка справедливая, то мы можем знать, что она выдаст. Если это монетка с блоком размером 2 (то есть блоками 0-1 и 1-0), то мы можем предсказать каждый второй результат. Мы не знаем, что выпадет в первом элементе блока, но знаем, что во втором. Если это блок размером 4, то мы всегда будем знать, что выпадет в конце блока. А иногда сможем предсказать два последних элемента блока.
Скажем, после 0-1-0-? всегда будет 1. А после 0-0-?-? всегда будет 2 единицы. Потому что внутри блока число 0 и 1 равно.

Data Medicine

09 Feb, 12:49


Итак, как достичь баланса между группами по фактору риска не нарушая рандомизацию? Рандомизировать отдельно подгруппы с фактором риск и без фактора риска используя блоковую рандомизацию. Блоковая рандомизация -- это такая рандомизация, которая не дает большой дисбаланс между вмешательством и контролем. "Обычная монетка" теоретически может выпасть 50 раз подряд орлом, или 40 раз орлом и 10 раз решкой. Группы окажутся не равны. Необычная "справедливая" монетка (не путать с Монеточкой) следит, чтобы всем доставалось по-ровну. Один из вариантов такой монеточки -- блоковая рандомизация. В блоковой рандомизации (которую, кстати, использовал еще сам Фишер в своих ботанических эксперитментах) последовательность рандомизации разбивается на блоки, в которых число интервенций и контролей равно, но случайно перемешано. Например, если это блоки по 2, то рандомизация происходит парами 0-1 или 1-0 в случайном порядке (где 1 -- вмешательство, 0 -- контроль):
0-1 1-0 1-0 0-1 ... и т. д.
Если блоки по 4, то в случайном порядке идут блоки [1-1-0-0], [1-0-0-1], [1-0-1-0], [0-1-0-1], [0-1-1-0], [0-0-1-1].

Data Medicine

09 Feb, 12:41


опять цитата из Стивена Сенна

Data Medicine

09 Feb, 12:37


Тем не менее, если какой-то важный прогностический фактор окажется сильно разбалансирован, это снизит эффективность исследования, как эксперимента. Представим себе, что изучаемая болезнь сильно чаще встречается у мужчин, чем у женщин, и так случится, что в группу вмешательства попадут одни женщины, а в группу контроля -- одни мужчины. Это маловероятное событие, и оно плохо совместимо с нулевой гипотезой (как, впрочем, и с любой другой), но поскольку наше p-value не оценивает за счет чего наши данные такие странные, а только сам факт их странности при допущении о верности нулевой гипотезы, то мы получим статистически значимый результат, даже если вмешательство не работает. Нет никакого способа полностью исключить такую игру случая, можно лишь учесть влияние определенных факторов риска и сделать эксперимент чуть более эффективным. Самый надежный способ -- взять выборку побольше, там с высокой вероятностью рандомизация все отбалансирует. Можно подстраховаться и гарантировать баланс хотя бы по самым важным из известных нам прогностических факторов. Это помимо прочего сделает и более эффективным сравнение вмешательства в группах: ведь если у нас нет баланса по важному фактору риска, у нас окажутся сильно неравными группы вмешательства и контроля внутри группы с фактором риска и без него.

Data Medicine

09 Feb, 12:22


Тут я процитирую твиттер Стивена Сенна:
Что не говорил Р. А. Фишер:
1) "Рандомизация выравнивает все конфаундеры".
Что говорил Р. А. Фишер:
2) "Рандомизация позволяет надежно оценить неопределенность, обусловленную неизвестными конфаундерами"
Что говорит Стивен Джон Сенн:
"Если вы придерживаетесь первой точки зрения, то продолжайте учить матчасть, пока не станете придерживаться второй точки зрения".
https://twitter.com/stephensenn/status/1470042516544229384

Data Medicine

09 Feb, 12:20


Что такое стратифицированная рандомизация, как она делается и зачем она нужна?
Обычная рандомизация не гарантирует баланс групп, она вообще не совсем про это. Сам по себе дисбаланс групп, вызванный рандомизацией -- не проблема, поскольку он случайный, и даже если он привел к тому, что в одну группу попали пациенты более высокого риска, чем в другую, это все учитывается в результирующем p-value. Т.е. по большому счету не создает особых проблем. Поэтому, кстати, некорректно говорить, что "рандомизация не удалась", если группы сильно несбалансированы по каким-либо переменным. Удалась, просто вот так вот причудливо.

Data Medicine

09 Feb, 12:07


Ну вот и готово, 2 страты по 150 конвертов. Хороший повод обсудить стратифицированную рандомизацию и консилмент.

Data Medicine

09 Feb, 10:31


Рандомизация оказалась утомительным процессом.

Data Medicine

08 Feb, 12:43


На правах безвозмездной рекламы. Поэтому без всяких гарантий, что это полезно и интересно. Если кто-нибудь сходит на вебинар, будет интересно послушать впечатления в комментариях.

Data Medicine

08 Feb, 12:41


Приглашаем на открытый карьерный вебинар «Прожарка вакансий» от OpenBio!

9 февраля, в рамках запуска курса «Машинное обучение в биологии и биомедицине», три эксперта из сферы биотеха встретятся, чтобы в прямом эфире прожарить свежие вакансии, и на их примере разобрать:

основные требования к специалистам биотех сферы;
навыки, необходимые для успешного продвижения;
а также возможные подводные камни на пути начинающего специалиста, и как их обойти.

Встреча состоится 9 февраля в 12:00 по мск

➡️ Обязательно зарегистрируйтесь, чтобы получить ссылку на эфир.

Подробнее о спикерах:

Екатерина Титова — HR-консультант, рекрутер в сфере биотехнологий, искусственного интеллекта, IT и фармацевтики, ex BostonGene, ex J&J, более 12 лет в HR.
Даниил Игумнов — биоинформатик, data scientist, researcher в Gero. Ex Vivan Therapeutics, ex Armenian Bioinformatics Institute.
Наталья Мнафки — продюсер и методолог программы «Машинное обучение в биологии и биомедицине», эксперт по карьерным трекам в биотехе, более 13 лет в индустрии.

Подписывайтесь на канал проекта, чтобы быть в курсе всех новостей и анонсов.

До встречи!

Data Medicine

19 Jan, 14:58


Психиатры о чем-то догадывались уже в 2008 г.

Data Medicine

17 Jan, 18:58


Вот тут трогательное от РУДН им. Патриса Лумумбы: кафедра семейной медицины с курсом паллиативной медицинской помощи за 10 месяцев и 195 000 рублей в очно-заочном формате сделает из вчерашнего студента врача-хирурга. Куррикулум, простите, состоит из 11 тем, про работу в операционной (к счастью) ни слова.
https://fnmo.rudn.ru/programs/khirurgiya-professionalnaya-perepodgotovka-1296-chasov/

Data Medicine

17 Jan, 18:36


Это еще и интересный пример самокоррекции бюрократии. Может показаться, что бюрократия нарастает и скоро всем придет конец. Количество приказов нарастает, допуск к работе становится все сложнее. Но когда становится слишком сложно, бюрократия делает дырку. Это постановление по сути — просто скрытая отмена отмены интернатуры. Интернатуру окончательно отменили в 2018 г., что существенно продлило время допуска к работе. Специализация через переподготовку в 1296 часов (10 месяцев) после первичной аккредитации (т.е. института) — это по сути возвращение интернатуры без отмены отмены интернатуры.
Хорошая демонстрация того, что любые благие намерения, реализованные административным путем, обречены на провал. "Давайте готовить врачей 2 года, пусть все идут в ординатуру". Да, давайте, вот приказ. А вот еще маленький приказик, что если очень хочется, то можно и без ординатуры. Бюрократия ужасна, но в основном она описывает статус кво, а не создает его.
Конечно, есть и жертвы — люди, которые верят в НПА. Им, действительно, конец :)

Data Medicine

17 Jan, 18:22


Но если уж как-то оценивать эту ситуацию, то я ее оцениваю скорее как положительную. Бюрократия устроена так, что она никогда себя не отменяет. Дерегуляции не существует, это миф. Но бюрократия может выхолащиваться. Т. е. все эти акредитации, сертификации, ординатуры и прочие фикции теряют содержание, и становятся чем-то вроде доброй традиции. Причем силами самой бюрократии: старые правила никто не отменяют, но появляются новые, позволяющие обойти старые. "А еще надо такой сертификат с гербом купить в ларьке и сдать в профсоюз деньги на конфеты детям к новому году, а потом идите работать". Это, как ни странно, открывает определенный простор для неформальных механизмов допуска к профессии. Если диплом ничего не стоит, значение приобретает репутация. Может быть это и не плохо.

Data Medicine

17 Jan, 18:21


Вот это письмо.

Data Medicine

17 Jan, 18:11


А вот еще о допуске в профессию (а то в комментариях пишут, что нельзя отменять специализацию, чтобы студенты не работали анестезиологами и хирургами).
Вышло постановление правительства от 27.12.2024 № 1931, где много всякого (про арктические леса, лицензии на спиртосодержащую продукцию, и пр.), но общий смысл — продление на 2025 г. "временных" законов, которые были по плану до конца 2024 г. Многие пункты так и звучат: заменить "2024 г." на "2025 г.".
Из медицинского там: продление инструкций к препаратам до конца 2025 г. (то, из-за чего все время что-то пропадает), изменения в начисление баллов в ординатуру, и последним пунктом: из постановления правительства 2351 исключить слова "и действует до 31 декабря 2024 г.". Т. е. теперь оно действует бессрочно.

А постановление это о том, что хирургом, анестезиологом и травматологом-ортопедом может стать любой врач, закончивший интернатуру или ординатуру по любой клинической специальности, после переподготовки длительностью не менее 504 часов.
504 часа — это 3 месяца. И если вы наберете в гугле "хирургия 504 часа", то будет много предложений в пределах 20-30 000 рублей.

И веду я вовсе не к тому, что это ужасно, или, наоборот, прекрасно. А к тому, что сейчас фактически никакой "официальной" системы допуска специалистов к работе нет, одна сплошная фикция (неофициальная есть, и иногда довольно крепкая). Поэтому от ее полной отмены никто не пострадает. Вообще никто, кроме продавцов корочек и Минздрава (поскольку они одно).

Я, кстати, и узнал об этом из спам-рассылки, где мне за недорого предлагали стать хирургом, ссылаясь на это постановление.

Data Medicine

15 Jan, 18:36


Отчёт Флекснера, который мы заслужили (на самом деле, конечно, никто такого не заслуживает).
https://t.me/kommersant/77280

Data Medicine

15 Jan, 08:38


А вот в этой табличке интересно другое: там приведены NNT в зависимости от срока наблюдения. За 1 год, за 2 года и т. д. Если эффективность препарата, который принимает постоянно, стабильна, то NNT за n лет будет равна 1/n NNT за 1 год. И в принципе при всяких расчетах эффективности и проч. именно так и делают (иногда путают умножение с делением). Но тут приведены не рассчетные NNT, а наблюдавшиеся в конкретном исследовании со сроком наблюдения в 5 лет. И, например, по первому столбцу (первичная конечная точка) видно, что эффект нелинейный. За первый год NNT 215 (то есть на 215 человеко-лет предотвращен один исход), а за 5 лет NNT 25 (то есть на 25х5 = 125 человеко-лет предотвращен один исход). Если бы эффект был линейный, то NNT был бы одинаковым в пересчете на человеко-годы, а тут он вырос в 2 раза почти.
Выходит, статины надо пить долго, они проявляют свой эффект не сразу. С патофизиологической точки зрения это логично: они замедляют прогрессирование атеросклероза, что сказывается на долгосрочном риске, а не на краткосрочном.

Data Medicine

15 Jan, 06:41


Впрочем, о чем-то эта табличка с NNT нам все же говорит. Она напоминает нам, что большинство людей (а в первичной профилактике — подавляющее большинство) прекрасно обойдутся без медицины вовсе. И precision medicine эту ситуацию, понятно, никак не изменит: если человек не нуждается в imprecision medicine, тем более он не нуждается в precision medicine. В общем, она напоминает врачам, что они не спасители человечества. Это полезное напоминание, а то многих заносит :)

Data Medicine

15 Jan, 06:07


Ну и сомнителен аргумент, неявно продвигаемый этой картинкой. Подразумевается, что высокий NNT -- признак imprecision medicine, неточной медицины, приходится лечить многих, чтобы помочь одному. А "настоящая медицина" (precision, personalized, вот это все) будет иметь NNT = 1. Одного полечили, предотвратили один исход. Это ерунда. Чтобы NNT был равен 1, нужно чтобы исход был детерминирован и без лечения наступил бы в 100% случаев. Такого не бывает, поскольку нет (и не может быть) инструментов, позволяющих вычленить из общей группы больных тех, у кого точно наступит исход, и проблема не в неточности прогностических инструментов, а в самой природе биологических процессов.
Кроме того, те исходы, которые оцениваются в клинических испытаниях (и по которым считают NNT), это часто просто удобные для измерения исходы, тогда как лечение действует не только на них. Скажем, пациент с не очень тяжелой астмой может никогда не попасть в больницу с обострением (исхода не будет), но то лечение, которое оценивается по снижению частоты исходов, будет ему помогать быстрее бегать по утрам или реже пользоваться ингаляторами.
В общем, precision medicine — это здорово, но пока для своего продвижения она зачем-то пользуется очень непресижн аргументами.

Data Medicine

15 Jan, 05:58


Про NNT я уже писал однажды подробно в этом канале: https://t.me/c/1519957324/5732
Проблема с этой табличкой, где приводятся NNT для наиболее широко используемых препаратов, заключается в том, что NNT — это не абсолютная мера эффективности метода. Нельзя напрямую сравнивать NNT одного лекарства и другого, потому что NNT характеризует эффективность для конкретного исхода в определенной популяции за определенное время лечения/наблюдения.
Например, NNT статинов (Crestor) на картинке будет очень разным в зависимости от этих характеристик.
Вот для примера см. табличку на картинке: NNT для розувастатина по результатам одного исследования может отличаться в 10 раз в зависимости от того, какой исход мы смотрим и за какой срок. https://doi.org/10.1161/CIRCOUTCOMES.109.848473
Другой пример: NNT для одного и того же исхода и за одно и то же время отличается в 3 раза в зависимости от популяции (высокий риск — 53, низкий риск — 146).
https://doi.org/10.1093/fampra/cmx124

Data Medicine

14 Jan, 17:16


https://youtu.be/dZ4ynBAdpWc?si=cxTHbyZIDIRw8ruU
Лучше такая интерпретация DNA.

Data Medicine

14 Jan, 16:46


Как вам такая интерпретация NNT?

Data Medicine

14 Jan, 16:45


Пространство для улучшения

Во-первых, спасибо всем, кто на меня подписался после ролика с Ирой, я постараюсь вас не разочаровать.

Во-вторых, после всех духоподъемных разговоров о крутейших лекарствах — отрезвляющая картинка. Она из 2015 года, но ситуация сильно лучше не стала. Самые распространенные (в США) лекарства помогают лишь 5-25% пациентов. Так что пространство для улучшения огромное, впереди еще много инноваций.

А если кто-то хочет поучаствовать в инвестировании в новые лекарства — пишите в личку!

Data Medicine

14 Jan, 07:00


К арестам счетов больниц мы уже привыкли. Но тут целый региональный Минздрав...
https://t.me/mediamedics/10975

Data Medicine

13 Jan, 17:17


Эхо пандемии: коллапс новых и продолжение коллапса старых инфекционных больниц. https://t.me/mediamedics/10972

Data Medicine

24 Dec, 18:30


Medicare финансирует последипломное медицинское образование (GME) через два основных механизма: прямые выплаты на последипломное медицинское образование (Direct Graduate Medical Education, DGME) и косвенные выплаты на медицинское образование (Indirect Medical Education, IME). DGME покрывает расходы, такие как зарплаты резидентов, пособия и время преподавания сотрудников, с учетом установленной для каждой больницы суммы на резидента (PRA), которая обычно варьирует от $100 000 до 150 000 в год. Из этих денег, ¾ уходит на зарплату и бенефиты. Плюс, из этих денег платят Malpractice и субсидируют ротации в других местах, если не хватает index cases ( часто это хирургия ожогов, травмы, трансплантация). IME компенсирует учебным больницам более высокие операционные расходы (более сложные пациенты, пациенты без страховок и пр.), рассчитываясь на основе соотношения резидентов к количеству коек, и не привязывается к отдельным резидентам.
В среднем, хирургического резидента обучают 30-40 attending surgeons за время обучения. Нет такого «ментора», который «ведёт резидента по жизни». Т.е. такой ментор может быть, но обычно этот термин имеет другое значение: это обучение карьерному росту, а не конкретным операциям. Исторически, некоторые программы предлагали год «персонального адъютанта» известного светилы (в моей близости – Джон Кэмерон из Хопкинса). Американский Борд Хирургов выступил категорически против такого обучения и под угрозой отзыва регистрации феллоушипа, такую практику прикрыли.
Учителя не несут непосредственной ответственности за навыки резидентов. Если судят резидента, то могут судить и аттендинга, но только за непостредственное оказание помощи пациенту, а не за то, что он «плохо научил». Непрямая ответсвенность другая, и это отдельный разговор.
Денег, выделяемых на резидентов, обычно едва хватает на покрытие административных расходов на резидентуру (администратов, доплата директору резидентуры и прочее). Специальных стипендий (endowments) на обучение на несколько порядков меньше по количеству и размеру, чем на научную работу. Могут находить и другие местные методы финансирования на обучение, наверное, но мне ни разу не встречались. Я не представлю, как с таким бюджетом напрямую финансировать тех хирургов, с которыми оперируют резиднеты и которые дают обратную связь после операции.
Ad hoc обучение (из общих соображений) - самый распространённый метод обучения. Сложнее стоновится, когда надо менять программу и демонстрировать результаты. Недавний челленж случился после введения ограничения рабочей недели до 80 часов и обязательного «обучающего дня». Через 10 лет после этих нововведений стали ощущать проблемы (по разным метрикам). Основное, хирурги стали заканчивать резидентуры с недостаточном количеством операций (на 20% меньше) и с пониманием, что для самостоятельной практики они часто не готовы и им нужна специализация только для того, чтобы самостоятельно оперировать на определённых пациентах. Так встала проблема, можно ли получить достаточно подготовленных хирургов в таких условиях. Без специальных знаний и специальных методов обучения похоже, что нельзя (сложно). Многие хирургические программы сейчас посылают своих faculty на курсы по преподаванию или на masters программы, так как считают, что без этого программы могут закрыться (а какое случается постоянно). Так что, если всё устраивает в своих преподавательских способностях, то и не надо ничему учиться. Многих не устраивает, и у этих людей есть свои причины тратить деньги и время на дополнительное образование.

Data Medicine

24 Dec, 08:45


В комментариях два американских доктора спорят, так это или не так. Видимо, где-то так, где-то не так. Там — большое и разное, поэтому с обобщениями надо быть осторожными. В России тоже ведь по-разному: где-то кафедра — это способ заработать, платные лекции почитать и т. д., а где-то заработки у врачей (ок, у хирургов) такие высокие, что академическая аффилиация — чисто для престижа, чтобы назваться профессором и где-нибудь в интервью упомянуть несуществующих "моих студентов".

Data Medicine

23 Dec, 20:29


Это не про то, как на самом деле. А про веру (надежду и любовь) российских врачей, что все дело в деньгах. И что резидентов в Америке учат, потому что наставникам за это платят деньги (и ещё немножко наказывают). Эта тема бесконечно всплывает в рассказах российских врачей про то, как "там". (На самом деле нет. Академическая карьера финансово не самая привлекательная.)

Источник: https://www.youtube.com/watch?v=_-WqYzRVY-0

Data Medicine

23 Dec, 20:28


Спасибо, что пользуетесь - @SaveAsBot'ом

Data Medicine

23 Dec, 07:22


Послушал на выходных медицинский подкаст, не только ведь самому записывать.
https://t.me/vamnekomne/23

Ведущие, онкологи Ирина Гридина и Андрей Исаев-Апостолов, разговаривают с участковым терапевтом Полиной Горбуновой. Разговор нервный и эмоционально напряженный, веселые музыкальные перебивочки не помогают (на самом деле сильно мешают).

Это не полотенце с петухами, но почти. Ключевой эпизод: Полину вызывают на дом к онкологическому пациенту с раком полости рта. Вызывают ее, чтобы она вызвала хирурга (без этого нельзя), а скорая пациента не берет, потому что онкологи рекомендовали ему лечение по месту жительства. По месту жительства молодой мужчина с дыркой в челюсти, откуда хлещет алая кровь. Доктор замирает в экзистенциальном ужасе, и тут входит дочка пациента и протягивает доктору белое полотенце, "чтобы не перепачкаться".

А ведущие обсуждают как быть и чем помочь. Может быть сделать справочник телефонов, куда звонить в таких случаях? Может быть онкологу стоит оставлять свои контакты в выписке для врача, но чтобы пациент ни в коем случае не звонил? Может быть сделать для участковых врачей какую-нибудь короткую шпаргалку по медицине, чтобы штудировать ее перед вызовами на дырку с кровотечением? Или курс пройти по дыркам и фебрильным нейтропениям (и такой курс от медапа уже предлагается)?

В общем, мораль, что участковый терапевт — тоже человек (его называют "ребенком после института") и нуждается в заботе.

Мне эти решения кажутся наивными, но своих у меня нет. Я вместе с терапевтом-ребенком замираю в экзистенциальном ужасе. Дайте белое полотенце и уведите ребенка...

Data Medicine

19 Dec, 13:51


Ну и не могу не воспользоваться случаем и не порекламировать Институт Биоинформатики, про который что-то знаю. https://bioinf.me/education/program
Там цена похожая, занятия по субботам, но зато целый учебный год. Но на программы Института Биоинформатики довольно большой конкурс и вступительные экзамены, и я думаю, что это правильно: это технически нагруженный курс и без определенного уровня программирования и математики может быть не стоит туда идти.
(я там читал несколько лекций по "доказательной медицине", чтобы это ни значило, и уровень студентов производит впечатление)

Data Medicine

19 Dec, 13:47


Это нереклама из чата комментариев, ничего про них не знаю. Но встреча бесплатная, можно послушать. Сам курс по машинному обучению в биомедицине — 3 месяца по 8-10 часов в неделю, стоит 75 000 рублей (подробности на сайте: https://edu.openbio.ru/mlforbiomed).

Data Medicine

19 Dec, 13:44


Здравствуйте, уважаемые коллеги!

Приглашаю вас на новый вебинар из серии бесплатных онлайн-встреч «Личный путь в сеньора биоинформатика» от OpenBio.
На встрече будут обсуждаться опции трудоустройства в сфере биоинформатики, варианты развития внутри индустрии и науки, а также способы, как попасть в эту сферу из смежных отраслей и что для этого нужно.

Вебинар «Карьерный путь биоинформатика: от студента до сеньора» состоится 24 декабря в 19:00 по Мск.

Спикер — Анна Фомина, химик, просветитель, выпускница Сколтеха по направлению «Life Sciences», со-основательница проекта о карьере в науке и образовании «Sci_Career», многократная победительница и финалистка премий «За верность науке», ментор и научный коммуникатор.

Регистрация и подробности по ссылке.

Также в программе заявлены следующие встречи:

6 января. Андрей Девяткин. К.б.н., зав. лаборатории вычислительных методов в биомедицине, МФТИ.
21 января. Дмитрий Пензар. Преподаватель ФББ МГУ и исследователь, ко-руководитель группы машинного обучения в биологии, ФББ МГУ.
4 февраля. Арсений Зинкевич. Биоинформатик, менеджер магистерской программы по ИИ в биологии.
18 февраля. Ольга Кардымон. Биолог, биоинформатик, научный сотрудник и руководитель группы «Биоинформатика» в AIRI.

Подписывайтесь на канал проекта, чтобы быть в курсе новых анонсов.

Большое спасибо за внимание, до встречи на эфирах!

Data Medicine

16 Dec, 17:19


https://moreisdifferent.blog/p/wth-is-cerebrolysin-actually
Церебролизин вдруг заметили на западе. Не в хорошем смысле. (по наводке от Ильи Ясного, его канал: https://t.me/LanceBio)
и еще: https://forbetterscience.com/2024/10/08/cerebrolysin-sharmas-masliah-and-ever-pharma

Data Medicine

13 Dec, 15:51


Мне кажется, что анонс кардиоонкологической конференции можно было сделать гораздо более оптимистичным:
1) Лишь 1 из 30 пациентов, получающих кардиотоксичную химиотерапию, столкнется с серьезными побочными эффектами, требующими лечения у кардиолога.
2) В остальных случаях эти побочные эффекты не повлияют на прогноз, поэтому выявлять их не обязательно, особенно если это задерживает, удорожает или усложняет лечение.
3) Эпидемия кардиоонкологии уже с нами, и ничего с этим не поделаешь. Поэтому приезжайте на конференцию по еврокардиоонкологии, Флоренция в июне, наверное, прекрасна.

Data Medicine

13 Dec, 15:48


Можно почитать исследование, но можно ограничиться графическим абстрактом. Он неплохо отражает содержание, хотя кое-что скрывает.
Из абстракта не видно, что в исследование включали только тех, кого лечили препаратами, относящимися к умеренно или сильно кардиотоксичным. То есть уже выборка высокого риска.
Ну а дальше: у каждого третьего развивались не серьезные осложнения, а хоть какие-нибудь. Тяжелые развивались только у 3%, то есть у каждого тридцатого. Польза лечения, как написано на картинке, для нетяжелой кардиотоксичности, не определена. То есть заголовок, что "сердечные побочные эффекты онкологического лечения рака надо лечить как можно раньше", не оправдан. Тяжелая кардиотоксичность — это симптомная сердечная недостаточность и ее лечат как обычную сердечную недостаточность. То есть так же, как обычные кардиологи (не онко). Во всех остальных случаях кардиотоксичности прогноз, как видно на графике выживаемости, очень даже неплохой (правда, у графика отрезали нижнюю половинку, чтобы кривые выглядели пострашнее).

Data Medicine

13 Dec, 15:42


Не так давно разбирали тезис, спасает ли грамотный онколог тысячу жизней. Кажется, так и не пришли к однозначному выводу (но и к трехзначному не пришли). Но такие вольности с числами характерны не только для онкологов, но и для кардиоонкологов :)
Получил рассылку от Европейского общества кардиологов с анонсом митинга по кардиоонкологии.

Побочные эффекты онкологического лечения со стороны сердца следует выявлять как можно раньше!
1) Каждый третий столкнется с серьезными побочными эффектами лечения рака со стороны сердечно-сосудистой системы.
2) В следующие десятилетия у нас будет эпидемия кардиоонкологии из-за старения населения и увеличения числа людей, выживших после лечения рака.
3) Новый конгресс Еврпейского общества кардиологов по кардиоонкологии будет посвящен этой теме.

Решил посмотреть, откуда цифры. А там и ссылка есть на исследование:

Data Medicine

11 Dec, 05:51


Вышел очередной выпуск нашего подксата про медицину и медицинское образование

https://www.izobretaemvelosiped.ru/s4e1
#s4e1 Из анестезиолога в терапевты: путь самурая

В гостях Алексей Баженов, когда-то анестезиолог, а теперь врач-резидент по терапии.

Из анестезиолога в терапевты -- взлет или падение? Или просто способ лететь дальше?

Что такое резидентура -- работа или учеба? И почему первый год такой трудный?

Что такое компетентностный подход? И существует ли он на самом деле?

Медицина загадок и медицина чеклистов -- в чем разница?

Ну и всякое другое интересное.

Data Medicine

07 Dec, 07:18


В Эстонии переход на высшее образование сестёр принёс много пользы. Во первых профсоюз за последние 10 лет существенно поднял им зарплату, теперь это 12 Евро в час нетто, что чуть больше средней зарплаты в стране. За эти деньги работодатели хотят достаточно большой сестринской самостоятельности: сестры ведут самостоятельные приёмы (диабетическая стопа, беременные, перевязки после операций, коррекция инсулина, коррекция лечения и консультирование пациентов с хронической болью и много ещё). Семейные сестры имеют право выписки рецептов и тоже ведут большую параллельную работу с врачом: у одного семейного врача как правило 2-3 сестры. Все это требует высшего образования, которое частично выступает неким фильтром, что люди, которые не справятся с теоретической программой просто не попадут на позицию сестры. Практическая часть работы занимает тоже много времени и как то не выглядит, что сестры плохо подготовленные приходят. Они обычно начинают подрабатывать помощницей сестры ещё на 2-3 курсе в том отделении, куда потом планируют придти, график учеб гибкий, есть учебные оплачиваемые дни и такое совмещение приветствуется обоими сторонами (работодатель и университет).

Data Medicine

07 Dec, 07:12


Могу написать про эстонскую ЦРБ (г Кохтла Ярве, русскоязычный промышленный регион, эстонский Донбасс со всеми имеющимися известными проблемами и будущими не менее известными рисками).
1. Тарифы единые общегосударственные. Ступенчатость помощи регулируется уровня и больницы: есть 2 региональные (самые крупные) - Тарту и Таллинн. Онкология, нейрохирургия, кардиохирургия только там. 4 центральные поменьше (2 в Таллинне, 1 в Пярну и 1 в Кохтла Ярве (обслуживаем весь северо восток). ЛОР хирургия, ортопедия, гинекология, катлаб плановый, офтальмохирургия. И локальные больницы, самые маленькие, у них экстренная медицина, общая хирургия и терапия, диализ.
Тарифы в стационаре по законченному случаю, амбулаторном по факту. Заинтересованность больниц в пациента регулируется тарифом: пациенты, патологии, которые не должны лежать в больнице типа радикулита или нетяжёлой пневмонии, имеют тариф непривлекательный. Онкологические диагнозы финансируются очень хорошо, поэтому по всей стране ездит десант из 2х региональных больниц, делает амбулаторные приёмы и забирает себе пациентов, конкурируя между собой. Уже назначенная химиотерапия причём проводится в регионах на базе более мелких больниц для удобства пациентов (в рамках договоров о сотрудничестве насколько я понимаю. Координирует работу их онколог, помещения и сестры наши, препараты бесплатные).
Больницы это самостоятельные экономические субъекты, владелец или город или государство или муниципалитет. Совет больницы, состоящий как правило пополам из политиков и врачей государственного уровня назначает руководство из 3х человек на 5 лет (руководитель (как правило не врач), главврач, главная сестра). Они управляют больницей. Больница ведёт экономическую деятельность путем зарабатывания денег на продаже услуг. Как правило основной заказчик это больничная касса (аналог ФОМС), которая каждый год составляет договор на оказание услуг по направлениям с фиксированной суммой. Превышение договора разрешается, но применяется понижающий коэффициент. От 0.7 для дневной хирургии до 0.3 для стационарной помощи. Не запрещена и любая иная коммерческая деятельность от прямой продажи мед услуг до сдачи в аренду помещений под аптеки, ларьки и другие магазинчики с вспомогательными товарами для маломобильных людей например. Больницы сами закупают оборудование, автомобили, лекарства, расходник. Строят новые корпуса (обычно при поддержке европейских фондов но обязательно с частью самофинансирования) , ведут зарплатную политику (минимальная зарплата каждые 2 года определяется на трехсторонних переговорах профсоюза, больничной кассы (плательщик) и союза больниц (работодатель). Владелец больницы (город, волость и т д) экономически не участвует в жизни больницы, но и не забирает прибыль. Больницы в целом прибыльны, большие больницы сильно прибыльны. https://rus.postimees.ee/8005381/deneg-na-lechenie-net-krupneyshie-bolnicy-estonii-zavershili-god-s-neveroyatnoy-pribylyu
В нашей больнице осенью после отпусков начинается традиционное закручивание расходов с криками все пропало, мы разорены, но год опять же традиционно заканчивается с прибыль, так как октябрь - декабрь всегда очень плодотворны: и пациенты и персонал на месте, на улице темно и грустно, нечем заняться кроме как работать или лечиться.

Data Medicine

06 Dec, 18:40


На прямой вопрос, не приходится ли делать что-то под давлением администрации: нет, не приходится, даже речи нет об этом, мы же врачи, зачем нам это надо? Убытки больницы — не наша проблема. (Тут я почувствовал, что я если и псих, то не один.)

Data Medicine

06 Dec, 18:33


11. Электронная история болезни — в каждом госпитале. Давно ничего не пишет от руки. Есть единая система выписки электронных рецептов — пациенту сообщается номер рецепта и он с ним идет в аптеку. Но в каждой больнице своя электронная история болезни, "федеральной" и "региональной" МИС нет, это проблема [Ха, попробовал бы он региональную МИС — АО]. К идее общей европейской медицинской системы относится более, чем скептически.
12. Основная проблема для пациентов — листы ожидания. Две недели на госпитализацию, несколько месяцев на МРТ. Частично решается за счет частных клиник.
13. С научными исследованиями сложно — финансируются скудно, оборудования не хватает, многие вещи делаются на коленке. Помогает международное сотрудничество.
14. Last but not least. Он профессор, с кучей публикаций в топовых журналах и т. д. и т. п. Но основная его работа — клиническая практика, и не "обходы профессора", а обычное лечение. Даже ночные дежурства приходится брать. И платят ему именно за это.

В общем, мне понравилось.

Data Medicine

06 Dec, 18:33


Послушал интересный рассказ польского врача об их системе здравоохранения. Из интересного в довольно случайном порядке:
1. Тарифы низкие, не покрывают расходы. Оплата идет по диагнозу при выписке. В его отделении (диабет) самый высокий тариф — диабетическая стопа, около 1300 евро, этого, конечно, не хватает. Долги растут. [Кхм. Мне тут недавно принесли из страховой бумагу — за лечение пациентки с деменцией, которая провела у нас в отделении 1,5 месяца, наложили штрафные санкции — не показали неврологу и психиатру. Вместо 7200 заплатили 3600. Не евро. — АО]
2. Отделения в госклинике работают в убыток, директор с ним периодически об этом разговаривает, но сама все понимает и сделать ничего не может. Не закрывать же отделение. Можно ли экономить? Ну да, скажем, если какое-то обследование можно пройти амбулаторно, то он назначает амбулаторно, но в целом делает все, что считает нужным. С некоторой гордостью — я один делаю больнице убытка на 25000 евро в месяц.
3. Зарплаты фиксированные, платят за "время на работе". С 8:30 до 14:08. У начинающего врача (типа резидента) зарплата около 2500 евро/мес, это выше средней польской зарплаты. При этом они, конечно, жалуются, что это мало. Врачи редких специальностей (нейрохирурги, анестезиологи) могут зарабатывать сильно больше (до 1000 евро в сутки). В целом, зарплаты сильно выросли за последнее время, что снизило коррупцию в медицине (видимо, имеются в виду неформальные платежи).
4. Фиксированные зарплаты не позволяют администрации давить на врачей, поэтому клинические решения мало зависят от администрации. Врач может "лениться" и смотреть поменьше пациентов, зарплата не снизится, но у него в отделении таких нет.
5. Вообще, власть заведующего в госклининке довольно большая. Например, очереди на госпитализацию длинные, но он может своего больного положить без очереди (но этим не пользуется без нужды).
6. Основная вся медицина — бесплатная, финансируется госурадством напрямую из специального фонда. Лекарства в основном бесплатно, некоторые с соплатежами (типа, 20 евро в месяц за дорогие инсулины, но не все доплачивают).
7. Есть частная медицина, представлена в основном двумя крупными международными корпорациями — Medicover и BUPA. Это для богатых и кто хочет без очереди. Многие врачи днем работают в государственных, вечером ведут прием в частных. Из частной можно направить в стационар, но нельзя к государственному специалисту. Т. е. есть какие-то искусственные барьеры.
8. Врачи первичной помощи (семейные врач/врачи общей практики) получают подушевые деньги. Три евро в месяц с человека (здорового/больного — одинаково). Территориальных ограничений нет, можно брать в практику пациентов с любого конца страны. Чтобы практика работала, нужно не меньше 700 пациентов. Что-то можно дополнительно брать за визиты. обследования, анализы, но немного. Финансово выгодно работать в новых районах, где все молодые и здоровые. Традиционно (еще с "советских" времен) врачи первичной помощи в основном дают направления, но сейчас это начинает меняться (хотя финансово им выгодно ничего не лечить, а только направлять).
9. Medical overuse — не проблема. Врачи не склонны назначать лишнее, поскольку зарплата от этого не зависит, а юридические риски минимильны. Иски подают к госпиталю, госпиталь теоретически может переадресовать его к врачу, но фактически этого никогда не происходит.
10. С медицинскими сестрами сложно. Для гармонизации образования с ЕС закрыли медучилища (были как у нас — после 8 класса), теперь сестры учатся в университетах (бакалавриат + магистратура), но их там учат писать научные работы, а не ставить катетеры. Это не всегда то, что требуется в больнице. Работают по 12 часов, затем 2 суток отдых. Но зарплаты маленькие (1500 евро в месяц), поэтому многие обманывают систему и работают по схеме 12/48 сразу в двух больницах. С этим пытаются бороться, но результат ожидаемый — сестер не хватает. Много сестер из Украины и Беларуси с обычным "медучилищным" образованием (но не все хорошо говорят по-польски).

Data Medicine

02 Dec, 04:41


Статья очень в тему хирургического образования и профессионализма.

Data Medicine

02 Dec, 04:35


So many critical and difficult situations to go through! What is the solution? More powerful controlling institutions? Install a chip in the neurosurgeon's head and control him through with Artificial Intelligence? Or can we expect to have neurosurgeons like Dr. “KIRILOV” in CHEKHOV's short story [2]? The question which arises here immediately concerns Dr. “TROUPKINE”. By what accounting or human logic did he react in the situation in which he found? Is he a “trained” and “educated” doctor or a “formatted one”? These are among the many questions we must answer.

Data Medicine

02 Dec, 04:19


А саму статью советую прочесть, она очень даже земная. И я не уверен, что это в чистом виде "корчеватель".

Data Medicine

02 Dec, 04:11


Дело Корчевателя живет и побеждает: Practice of neurosurgery on Saturn
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2210261224009209

Data Medicine

30 Nov, 09:01


Очередная новость про победу ИИ, на этот раз — над ольховыми шишками.
Мне кажется, главная даже не проблема, а недоразумение во всех эти ИИ-прорывах, заключается в том, что мало кто понимает, чем занимается врач. Ясно только одно, что врач не занимается на работе решением ситуационных задач и тестов. Многим кажется, что врачи занимаются постановкой диагноза или решением каких-то похожих интеллектуальных задач.
Я сам тоже не претендую на понимание: на работу хожу, что-то делаю, но сильно бы затруднился описать, что именно. Посмотрел свой прием за 2 дня: там как-то маловато было задач для "интеллекта", что искусственного, что естественного. Много менеджмента, созвонов, разговоров, и почти ни одного нового "диагноза".
И это проблема не только ИИ, но и всех этих экзаменов, аккредитаций и прочего. Они тоже исходят из предпосылки, что врач что-то такое интеллектуальное делает: получает информацию на входе, выдает на выходе. А что уж там конкретно, ольховые шишки или пембролизумаб — дело десятое. Неверна сама предпосылка. Поэтому и все попытки "образовать врачей", научить их доказательной медицине и прочее, дают такие странные результаты.

Data Medicine

30 Nov, 08:56


Просто напоминаю, какие вопросы в аккредитации, который прошел ГигаЧат

Data Medicine

30 Nov, 08:55


Впервые в России аккредитационный экзамен на врача сдала нейросеть, модель Сбера GigaChat прошла аккредитацию на базе Сеченовского Университета, пишет Лента.ру.

Подобный экзамен сдается в два этапа: тест и ситуационные задачи.

«После таких тестов  выпускники медвузов могут работать в системе российского здравоохранения. Теперь у GigaChat такие же знания, и оказывая помощь врачу в принятии решения, нейросеть сэкономит его время и снизит рутинную нагрузку», заявили в компании.

Data Medicine

28 Nov, 16:23


Молодость подкралась незаметно...

Data Medicine

28 Nov, 16:23


Скворцова заявила, что 60-летние россияне скоро будут считаться молодыми

«Если брать классификацию ВОЗ, то молодой человек до 45 лет, я так думаю, с учётом увеличения продолжительности жизни, скоро это будет до 60, это будут всё молодые люди, потому что меняются совершенно возрастные периоды»,
— сказала руководитель Федерального медико-биологического агентства Вероника Скворцова.

Data Medicine

27 Nov, 05:40


В общем, похоже на игру в поддавки. У ИИ есть все шансы победить врачей и учёных, даже если он перестанет развиваться.

Data Medicine

27 Nov, 05:34


Врачи продолжают держать рубеж, но скрипят. Обычные врачи (которые пользуются аптудейтом) оказались не хуже врачей, которые пользуются ИИ (GPT) в решении бумажных клинических задачек. Впрочем, GPT в одиночку справлялся с задачками лучше, чем врачи с GPT, но это не точно — это было эксплораторной конечной точкой, даже не вторичной, но авторы не удержались и именно этот дополнительный исход включили в выводы. В подтасовывании результатов человеку пока равных нет.

Data Medicine

27 Nov, 05:27


Large Language Model Influence on Diagnostic Reasoning: A Randomized Clinical Trial | Clinical Decision Support | JAMA Network Open | JAMA Network
https://jamanetwork.com/journals/jamanetworkopen/fullarticle/2825395

Data Medicine

21 Nov, 17:14


Послушал подкаст. Очень интересно, хотя впечатления неоднозначные.
Четыре человека из одного из богатейших институтов Европы (того, который присуждает нобелевскую премию по медицине) критикуют статью вьетнамских авторов.
Содержание статьи упоминается достаточно туманно, больше про методы. Но ясно, что в статье авторы пытаются рассказать о том, что вьетнамские врачи, которые прошли программу по медицинскому образованию в Маастрихте, вернувшись во Вьетнам не преуспели. Никто из них не стал профессором и не возглавил собственную образовательную программу, все их начинания встречают сопротивление местной элиты, маленькие зарплаты, непризнание заграничных дипломов и т. д. Авторы статьи это корректно называют "контекстом", который необходимо учитывать при попытке внести изменения.
Критика вертится в основном вокруг методов. Авторов упрекают, что они не придерижваются теоретического фреймворка или что он у них слишком размыт. Одновременно с этим, один из ведущих говорит, что ему не хватило в статье графической схемы теоретического фреймворка, а то их сейчас много развелось и не всегда помнишь, какой именно фреймворк из чего состоит. Авторы при этом для описания своего фреймворка ссылаются на статью одной из ведущих подкаста. Эта ведущая охотно рассуждает (впрочем, не без иронии), что в теориях легко запутаться, поскольку их сейчас уже очень много, и они как раз пишут книгу с описанием 100 теорий, самых релевантных для медицинского образования.
Там много этого педагогического волапюка, я использую "фреймворк", а там есть и парадигма, и линза, и теория, и все что полагается в таких статьях вместо ссылок на труды Маркса, Ленина и Семашко. Интересно, что один из критиков жалуется, что выборка маленькая и не репрезентативная — из 16 прошедших обучение опросили только 8 и то 2 из них уже на пенсии (а 8 неопрошенных вообще ушли из медицинского образования). Интересно, потому что качественные исследования в принципе не предполагают репрезентативности и вопрос о достаточной выборке для них не имеет смысла. Но ведущие обеспокоены тем, что другие голоса не были услышаны. (Не сомневаюсь, что есть и голоса, которые рассказали бы, что вьетнамское медицинское образование самое лучшее.)
В общем, интересная история о том, как все эти педагогические теории провалились и не помогли вьетнамским эдукейтерам, прошедшим магистратуру по обучательству. И то, как это критикуется обучательским истеблишментом, лишний раз объясняет, почему это не сработало. Потому что вместо того, чтобы понять, а почему там во Вьетнаме все не работает, они решили, что надо просто пройти программу по обучательству в правильном теоретическом фреймворке и все будет как в Каролинске. Но почему-то апельсинки, родившиеся от каролински, на льдинке не расцвели.
Подкаст, тем не менее, очень интересный, буду слушать другие выпуски. А статья, думаю, еще более интересная, но еще не читал.
p.s. Готов к возражению, что это были неправильные педагогические теории, а новые версии уже учитывают контекст.

Hu, W. C.-Y., Nguyen, V. A. T., Nguyen, N. T., & Stalmeijer, R. E. (2023). Becoming Agents of Change: Contextual Influences on Medical Educator Professionalization and Practice in a LMIC Context. Teaching and Learning in Medicine, 35(3), 323–334.

Data Medicine

21 Nov, 12:41


Это графики оттуда: смертность тоже идет ноздря в ноздрю, а неплановых госпитализаций по поводу вмешательства на клапане чуть больше, но комбинированная конечная точка не достигает статистической значимости. На мой взгляд, эти исследования не противоречат друг другу, а дают ту же картину. Второе чуть ближе к реальной жизки, поскольку не спонсировалось производителем и вмашетсльства даже в группе вмешательства делались не сразу (вторая картинка), как и бывает в реальной жизни.
А вот выводы авторов статей из данных совершенно противоположные. Лишнее напоминание, что надо читать статью, а не абcтракт.

Data Medicine

21 Nov, 12:29


Итак, подводя итог. О чем мне рассказало это исследование? О том, что если у пациента есть тяжелый аортальный стеноз и он живет в США, то скорее всего его прооперируют как только он на что-нибудь пожалуется. Даже если исходно думали наблюдать.
Еще о том, что в условиях доступности ТАВИ можно с чистой совестью наблюдать: если ему понадобится операция, его довольно быстро прооперируют, и эта экстренность не скажется на риске больших осложнений и смерти. Да, через 5 лет большинство больных получат вмешательство на клапане, а через год — половина, но торопиться на обязательно. Некоторые спокойно проживут без операции несколько лет.

Изменит ли это мою тактику с пациентами низкого риска и бесссимптомным аортальным стенозом? Вряд ли. Опираясь на имеющиеся данные и собственные знания о том, сколько занимает в России ожидание операции, я и так рекомендую хирургическое лечение при тяжелом стенозе. Не потому что наблюдаться опасно, а потому что когда показания появятся, может не оказаться квот, пациенту будет сложнее мотаться по клиникам и проходить исследование и т. д. Небольшие избыточные риски, связанные с ранней хирургией — это плата за кривую систему здравоохранения. Как в анекдоте: иногда за место на кладбище приходится платить тем, что ложиться надо будет завтра :)

При этом у меня есть несколько пациентов с бессимптомным тяжелым аортальным стенозом, которые вполне осознанно отказались от направления на ТАВИ. Это в основном очень пожилые люди, и я сильно не уверен, что на них можно транслировать результаты этого исследования. И еще больше таких, кого я направил на опреацию, но им не удалось пробиться через все административные барьеры на пути к операции.

Если бы я работал в США, где ТАВИ доступно, я бы сделал такой вывод: можно обсудить ситуацию с пациентом, составить план на случай появления симптомов и дейстовать соответствующим образом при их появлении. Т. е. для меня это исследование — аргумент в пользу активного наблюдения.

Data Medicine

21 Nov, 12:18


Из таблицы в приложении видно, что основным драйвером вмешательства в группе наблюдения была одышка. И это логично. Представьте себе, что у вас есть пациент с известным тяжелым аортальным стенозом, у которого появляется одышка. Который к тому же сам знает, что у него аортальный стеноз. Первое движение — госпитализировать от греха подальше, а там уж понятно, что сделают ТАВИ.

Data Medicine

21 Nov, 12:14


Тут очень сильно удивляет, что эта эксплораторная конечная точка выглядит как подмножество исходной первичной конечной точки (взяли неплановую госпитализацию только из-за тяжелых симптомов), но кумулятивная вероятность этой "ограниченной" конечной точки оказалась выше, чем исходной.

Data Medicine

21 Nov, 12:11


Что же они считали "серьезными симптомами"? Это можно узнать в приложении. Например, любая госпитализация из-за ухудшения симптомов считалась "серьезными симптомами".

Data Medicine

21 Nov, 11:50


Но вернемся к излому на кривой внеплановых госпитализаций. Для естественых процессов очень нехарактерны резкие изменения, обычно все происходит довольно плавно. Кстати, именно поэтому известная всем кардиологам кривая Росса и Браунвальда выживаемости при аортальном стеноза выглядит с эпидемиологической точки зрения совершенно неправдоподобно. Недавно я узнал, что эту кривую Росс и Браунвальд нарисовали на салфекте, когда обсуждали за ужином, что врачи направляют пациентов с аортальным стенозом слишком рано или слишком поздно. Для салфеточной кривой это простительно.

Data Medicine

21 Nov, 11:44


Очевидно, что первичная комбинированная конечная точка обусловлена в основном именно неплановым госпитализациями, но почему частоту этих госпитализаций так резко падает через полгода? И можно ли считать hazard ratio с помощью регрессии Кокса, если кривые настолько непропорциональны? Видно же, что в первые полгода HR будет одним (в группе наблюдения скорость исходом в разы больше), а потом кривые становятся почти параллельны (т. е. HR будет около 1).
Кстати, очень советую статью Эрнана Мигеля про hazard ratios и как их изменение во времени может вводить в заблуждение и что с этим делать: https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3653612/

Data Medicine

21 Nov, 11:41


Итак, возвращаясь к статье и кривым выживаемости. Что бросается в глаза? Вот этот излом (красная стрелка).

Data Medicine

21 Nov, 11:40


Статью Гайатта надо перечитывать почаще. Я часто говорю о диссоциации кафедры и клиники в постсоветском образовании, но ведь точно такое же процесс происходит и с "докмедом" в образовании российском: журнальные клубы и критическое чтение отдельно, а практика отдельно. Если вернуться к статье про аортальный стеноз, то многие кардиологи принципиально не решают вопрос о хирургическом лечении своих пациентов, а делегируют это кардиохирургу. Кардиохирург (и это совершенно без претензии, так и должно быть) больше смотрит не на то нужна ли операция, а на то, возможна ли она с невысокими рисками. В результате многим врачам все эти гайдлайны немножко до лампочки: есть "маршрут" пациента, и не надо отвлекаться. Статьями займемся после работы.
Ровно так, кстати, ответили в докмед-чате на вопрос "как решить, кого направлять к липидологу": есть порядки и стандарты, там все прописано. Ну ок, но тогда на досуге лучше не докмедом заниматься, а чем-нибудь более продуктивным: цветы посадить, старушку через дорогу перевести, в боулинг сходить.

Data Medicine

21 Nov, 11:23


Интересная статья про реформу медицинского образования в России начала советской власти на примере Томского университета.

Data Medicine

20 Nov, 17:59


А это статья Гайатта о доказательной медицине. Все ссылаются на нее как на "первое упоминание EBM", а на мой взгляд интересно почитать. Там EBM -- это больше про способ учить медицине. Ну и просто историческое погружение: ничего сложного, пишет Гайатт, сходить в библиотеку, найти пару статей программой Grateful Med, заплатив за это 2.68$, сделать фотокопии и подготовить ответ на клинический вопрос. За полчаса можно успеть.
Есть русский перевод, выполненной Никитой Бурловым с коллегами: https://www.rosoncoweb.ru/news/oncology/2022/07/28/

Data Medicine

20 Nov, 17:55


Guyatt, G. (1992). Evidence-Based Medicine. JAMA, 268(17), 2420. doi:10.1001/jama.1992.03490170092032

Data Medicine

20 Nov, 17:54


https://podcasts.apple.com/us/podcast/the-papers-podcast/id1668796306?i=1000672156906

Data Medicine

20 Nov, 17:54


Очень рекомендую прослушать этот выпуск подкаста. Он дает представление во-первых о том какая разница между профессией MedEd в западной медицине и незападной медицине например Вьетнама. Участники этого подкаста известные исследователи и популяризаторы медицинского образования из Канады. Во-вторых, надеюсь что участникам нашей предыдущей дискуссии будет небезинтересно узнать, как другие исследователи оценивают те же самые проблемы и вопросы, которые поднимались в этом чате. Надеюсь, этот выпуск подкаста понравится.

Data Medicine

18 Nov, 05:16


Про образование
Велено было подготовиться к урокам по труду. Купить и принести набор для вышивания. Два урока по 40 мин. Мы все сделали. Дочка пятиклассница рассказывает вечером. Вышивали мы 5 минут, в самом конце, вот результат. Остальное время писали в тетрадях. Что же вы писали, теорию вышивания? Нет, технику безопасности работы с утюгом. Все смеются.

Data Medicine

18 Nov, 05:15


Пост Алексея Мизина, навеянный жизнью и обсуждением медицинского образования в нашем канале.

Data Medicine

17 Nov, 09:44


Черный пояс по Джиу джитсу от Владимира Коршока.

Data Medicine

17 Nov, 09:44


Как учиться докторам?
Выпуск 1

Под этим амбициозным заголовком я попробую суммировать мои размышления об этом важнейшем вопросе и предложить решения.

Кризис развития медицинского образования тотален и ситуация становится хуже. Почему я так решил? Для этого достаточно посмотреть не на само образование, а на пациентов, которые не получают того, чего им нужно - решения их проблемы, понимания сути происходящего с ними, ощущения, что ситуация под контролем. И дело тут не в "капризных" пациентах. Дело, по моей глубокой убежденности в том, как устроена подготовка докторов. Основная часть времени, проведенного на обучение (я тут говорю не только про университет, но и про даже то образование, которое доктор получает сам уже практикую, в том числе по своему выбору и за деньги) - это теория. Лекции, курсы, чтение - то есть то, что напитывает знания, но не усиливает практические навыки. В итоге все то, как доктор, собственно, практикует - то есть то, как он строит свою работу, как он взаимодействует с пациентом на всех этапах, и главное - как он принимает решения (а это собственно то, за чем приходит пациент) остается без какой-либо супервизии. Доктор это делает так, как научился сам, следуя за интуицией и обстоятельствами.

Пока не очень понятно, да?
Давайте представим себе восточные единоборства. Например фехтование. Можно ли стать хорошим фехтовальщиком посетив все возможные мастер классы, лекции, семинары, прочтя несколько книг и даже монографию для преподавателей, но при этом занимаясь практикой только дома без супервизии?
Полагаю ответ очевиден.

Как же так вышло, что самый главный инструмент передачи практических навыков от учителя к ученику и практика под супервизией "старшего" коллеги был почти полностью утрачена?

Такой вариант обучения хоть в каком-то виде существует в хирургии, потому как по какой-то причине там более очевидно, что мануальные навыки никак не получится развить без практики под присмотром. Вместе с тем, докторов-хирургов завершивших формальное обучение и не выполнивших ни одной самостоятельной операции, не вылечив от начала и до конца ни одного пациента - навалом.
Что же касается докторов, которые не делают манипуляций (условно назовем их для простоты "терапевтическими", хотя это не совсем верно), обычно оказываются с пациентом один на один сразу после завершения университета и, даже если у них есть возможность спросить совет у более опытного коллеги, то этот совет будет сводиться к тому какие ему назначить лекарства, какую статью прочесть, но не к тому как собственно выстроить диалог с этим пациентом, провести супервизию запроса пациента и эффективнее выявить детали его анамнеза, идей и убеждений и собственно проанализировать предложенное решение с позиции более опытного коллеги.

Завтра расскажу о том как это устроено, например, в тех самых восточных единоборствах и что можно оттуда перенять нам - практикующим докторам.

Data Medicine

16 Nov, 10:53


В общем, ДЗМа на них нет, на этих лентяев.

Data Medicine

16 Nov, 10:50


И ещё о культурных аспектах медицины. Как русский менеджмент, бессмысленный и беспощадный, пытается внедрять свой устав. Это русская клиника (т.е. "клиника докмеда") в Португалии.

Data Medicine

15 Nov, 06:32


https://www.bmj.com/content/385/bmj.q1323

Data Medicine

15 Nov, 06:32


https://www.bmj.com/content/368/bmj.m226

Data Medicine

15 Nov, 06:32


В связи с обсуждением в чате моделей первичной помощи — transactional vs. relational — нашел две заметки в BMJ. У меня давно уже ощущение, что наша медицина далеко впереди всего мира — на конечной станции: той, куда прибывают другие системы здравоохранения. То, что другие рассматривают в качестве опасной перспективы, для нас вчерашний день. Но одновременно и завтрашний, потому что наши дни все одинаковы.

Data Medicine

14 Nov, 08:00


Есть и еще один аспект к.м.н., помимо успеха — из области defensive medicine. На одном конгрессе в секции по хирургическому образованию докладчик из большого НМИЦа (самого большого :), объяснял, что у них к операционному столу допускаются только защитивщиеся. "Ведь у нас область высокорисковая, и если пациент умрет, мы всегда можем сказать — оперировал кандидат наук".

Data Medicine

14 Nov, 07:57


Это Полина Шило делится в инстаграме. А недавно у нас в чате-канала как раз обсуждалось, зачем преподавателю заниматься наукой. Причем как в контексте "я бы пошел преподавать, но не хочу заниматься наукой", так и "чтобы преподавать, надо сначала получить PhD по преподавательству" (вспомнилась из "Теории большого взрыва" реплика Шелдона, обращенная к Пенни: "ты что, хочешь получить нобелевскую премию по официантству?").
Это какое-то противоречие между формой и содержанием, которое многих будоражит. Не только в России. И наука, и научные звания воспринимаются не как самостоятельная ценность, а как способ достичь чего-то еще (успеха, востребованности). Идея слайда с конгресса как раз в том, что можно добиться успеха и без PhD/кмн. То есть подразумевается, что вообще-то это все конечно для успеха.

Data Medicine

13 Nov, 08:38


А вот немного другой подход. Или даже совсем другой. Это сухие данные (на цитату вначале не обращайте внимания, там в середине есть таблицы и графики с цифрами).
Это что-то вроде выписки из больницы, где очень много анализов. Анализы сами по себе интересные, но не всегда по ним можно понять, что происходит с больным, и что делать.
https://www.vshouz.ru/upload/iblock/d04/um2dhsd2y63ki30ic6zx8fvdgvd13f2n/Kadrovoe_i_informatsionnoe_obespechenie_med_obrazovaniya_2023_r.pdf

Data Medicine

11 Nov, 17:34


Но каталки у них на Магадане зачётные в пульмонологии. Завидую белой завистью.

Data Medicine

11 Nov, 17:31


Appropriateness use criteria по-русски, или пока гром не грянет, мужик не перекрестится.
Вроде бы и посылка верная -- большинство МРТ-исследований делается без показаний, и факт прилипшей кровати неопровержим. Но всё-таки причинно-следственная связь не очевидна. Нужно применить критерии Брэдфорда Хилла. Ну или для начала просто посмотреть ассоциацию между количеством прилипших кроватей и необоснованностью показаний.

Data Medicine

10 Nov, 16:33


Коллеги прислали примечательную статью китайских коллег, в которой черным по белому написано:

As strongly requested by the reviewers, here we cite some references [[35], [36], [37], [38], [39], [40], [41], [42], [43], [44], [45], [46], [47]] although they are completely irrelevant to the present work.

Вот ссылка на статью в International Journal of Hydrogen Energy:

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0360319924043957

А вот ссылки, которые рецензенты потребовали добавить, хотя по мнению авторов они не имеют никакого отношения к содержанию статьи:

El-Ghobashy M, Hashim H, Darwish M, et al. Eco-friendly NiO/polydopamine nanocomposite for efficient removal of dyes from wastewater. Nanomaterials 2022;12(7). https://doi.org/10.3390/nano12071103.

Henaish AM, Darwish MA, Hemeda OM, et al. Structure and optoelectronic properties of ferroelectric PVA-PZT nanocomposites. Opt Mater 2023;138. https:// doi.org/10.1016/j.optmat.2022.113402.

Hussein MM, Saafan SA, Abosheiasha HF, et al. Structural and dielectric characterization of synthesized nano-BSTO/PVDF composites for smart sensor applications. Mater Adv 2023;4(22):5605–17. https://doi.org/10.1039/ D3MA00437F.

Hussein MM, Saafan SA, Abosheiasha HF, et al. Preparation, structural, magnetic, and AC electrical properties of synthesized CoFe2O4 nanoparticles and its PVDF composites. Mater Chem Phys 2024;317. https://doi.org/10.1016/j. matchemphys.2024.129041.

Migas DB, Turchenko VA, Rutkauskas AV, et al. Temperature induced structural and polarization features in BaFe12O19. J Mater Chem C 2023;11(36):12406–14. https://doi.org/10.1039/D3TC01533E.

Tishkevich DI, Grabchikov SS, Lastovskii SB, et al. Function composites materials for shielding applications: correlation between phase separation and attenuation properties. J Alloys Compd 2019;771:238–45. https://doi.org/10.1016/j. jallcom.2018.08.209.

Trukhanov SV, Fedotova VV, Trukhanov AV, et al. Cation ordering and magnetic properties of neodymium-barium manganites. Tech Phys 2008;53(1):49–54. https://doi.org/10.1134/S106378420801009X.

Trukhanov AV, Tishkevich DI, Timofeev AV, et al. Structural and electrodynamic characteristics of the spinel-based composite system. Ceram Int 2024;50(12): 21311–7. https://doi.org/10.1016/j.ceramint.2024.03.241.

Trukhanov AV, Turchenko VO, Bobrikov IA, et al. Crystal structure and magnetic properties of the BaFe12-xAlxO19 (x=0.1–1.2) solid solutions. J Magn Magn Mater 2015;393:253–9. https://doi.org/10.1016/j.jmmm.2015.05.076.

Trukhanov SV, Trukhanov AV, Vasiliev AN, et al. Frustrated exchange interactions formation at low temperatures and high hydrostatic pressures in La0.70Sr0.30MnO2.85. J Exp Theor Phys 2010;111(2):209–14. https://doi.org/ 10.1134/S106377611008008X.

Trukhanov SV, Zubar TI, Turchenko VA, et al. Exploration of crystal structure, magnetic and dielectric properties of titanium-barium hexaferrites. Mater Sci Eng, B 2021;272. https://doi.org/10.1016/j.mseb.2021.115345.

Vinnik DA, Starikov AY, Zhivulin VE, et al. Changes in the structure, magnetization, and resistivity of BaFe12–xTixO19. ACS Appl Electron Mater 2021;3 (4):1583–93. https://doi.org/10.1021/acsaelm.0c01081.

Zhivulin VE, Trofimov EA, Zaitseva OV, et al. Preparation, phase stability, and magnetization behavior of high entropy hexaferrites. iScience 2023;26(7). https:// doi.org/10.1016/j.isci.2023.107077.

Нетрудно заметить, что соавторами почти всех этих публикаций являются Алексей Валентинович и Сергей Валентинович Трухановы, которые помимо белорусских имеют и российские аффилиации. Я не знаю, кто был рецензентом, но похоже, что здесь мы имеем дело с практикой недобросовестной «накрутки» цитирований, что противоречит нормам научной этики. А китайские коллеги молодцы – с такой практикой можно бороться только широкой оглаской.

Data Medicine

10 Nov, 15:54


Просто название понравилось. Статья на самом деле не про больницы (это игра с цитатой из экономиста Ричарда Талера «The lunatics are running the asylum!», которую я бы перевел "психи руководят дурдомом"). Но подумалось, что с таким названием актуально было бы написать статью про российское здравоохранение.

Data Medicine

10 Nov, 15:52


Борисов К.Ю., Раскина Ю.В. Хорошо ли сумасшедшие руководят больницей? Субъективные рассуждения о прогрессе экономической науки, навеянные недавней книгой Ричарда Талера и его нобелевской премией. // Финансы и бизнес. 2018. № 2 (14). C. 4–19. DOI 10.31085/1814-4802-2018-14-2-4-19

Data Medicine

09 Nov, 11:26


Первая треть кривой — это новая машина с гарантией (выявление заводского брака и случайные поломки), средняя часть — нормальная машина со случайными поломками и регулярными "т.о." для замены масла и иллюзии надежности (сама не ломается или ломается случайно), третья часть — б/у машина, надо продавать или дружить с умным автомехаником (а не тем, кто любит проводить т.о. и много говорит о профилактической медицине).

Data Medicine

09 Nov, 11:22


Проблема в том, что профилактика и регулярные проверки работы станков, автомобилей и других механизмов не существенно продлевает срок их службы. Техобслуживание делается для замены расходных материалов, удаления пыли и замены небольшого числа быстро изнашивающихся деталей.

Есть целая теория о надежности механизмов. Для описания риска поломки деталей используется кривая в виде ванны. Исходит она из того, что пока деталь не износится, риск ее поломки постоянен, то есть описывается случайными процессами. А риск поломки механизма зависит от риска поломки отдельных деталей. Кстати, кажется из этой инженерной теории в медицину проник hazard ratio (по дороге от него отвалилась собственно hazard function).
На этих теориях основаны гарантии производителя и страховки: вероятность поломки постоянна, ее накапление можно рассчитать, и гарантия дается на то время, пока эта накопленная вероятность остается маленькой и маркетинговая стратегия гарантии приносит больше, чем замена (случайно) сломавшихся автомобилей. Все это происходит на плоской части ваннообразной кривой, до того, как детали начнут изнашиваться.
Из этого понятно, что нет смысла проверять детали и менять их перед поломкой. Быстро изнашивающиеся детали меняют по срокам, медленно изнашивающиеся — не меняют, их изнашивание происходит медленнее, чем накопление риска поломок множества неизношенных деталей, а значит автомобиля в целом.
Там же, где нужна очень большая надежность, используют такой дизайн, который нечувствителен к поломке отдельных деталей. Самолет может сесть с одним работающим двигателей. В датацентре поломка одного диска не грозит целостности данных. Никто не проверяет диски и не меняет их заблаговременно — потому что это случайный процесс. Проще поменять, когда он сломается.

То есть сама аналогия не верна. Конечно, на т. о. поменяют масло и возьмут деньги за продувку каких-нибудь очень важных форсунок. Но в здоровье этому соответствует регулярное питание и здоровый образ жизни, а не "чек-апы". А все остальное с автомобилями происходит по принципу обычной (непрофилактической) медицины — "как сломается, приезжайте". И, конечно же, как и в медицине, деньги автосервисы делают не на ремонте, а на продаже иллюзий: съездил на т.о., заплатил деньги и думаешь, что машина теперь не сломается. Сломается, но в другом месте.

Data Medicine

04 Nov, 16:58


У меня сегодня день обзора соцсетей по теме медицинского менеджмента, образования, лицензирования и проч. :)
На этот раз на тему "наши врачи там".
Оказывается преподавание в резидентуре в одной стране не открывает путь к медицинской практике в другой. И даже преподавание в двух крупных странах не открывает путь к медицинской практике в одной мелкой стране.

https://www.facebook.com/i.fomintsev/posts/pfbid0A7vTuRDLViREnt8ZmaHsTfYm2jxt9RqpWGvtAhp4rQoqYsGUcFwVFBQmuE5qSm3Cl

Data Medicine

04 Nov, 12:50


Похоже, корпоративной культурой и миссией теперь называют то, что раньше называли школой и кафедрой. "У нас на кафедре так не лечат" — и точка. Понятно ведь, что если у нас так не лечат, то у них, где лечат, корпоративная культура неправильная и миссия ужасная. Интересно, а можно ли в медицине обойтись без этого?

Data Medicine

04 Nov, 12:27


Я у себя в отделении периодически обнаруживаю в шкафу с лекарствами какой-нибудь кортексин, актовегин или мексидол. Раньше я недоумевал, откуда это там берется, выяснял, выкидывал, все такое в стиле Рассвета. Потом перестал. Сестры, наверное, кому-нибудь его вводят, когда меня нет. Но у нас нет корпоративной культуры, миссии, идеологии, диктатуры. У нас даже порядка нет. А сестры, может быть, так немного подрабатывают. Или даже сами себя лечат. Ну и пусть, мое ли это дело? Во-первых, я не уверен, что все в коллективе должны думать одинаково. Во-вторых, если какие-то важные для меня принципы оказываются чужды для моих сотрудников, это мои проблемы.
В общем, это не новость, конечно, но докмед тоже может быть идеологией. Долой идеологию!

Data Medicine

04 Nov, 12:18


"Доказательная медицина -- это когда смеёшься над неврологами, которые говорят, что видят эффект от Мексидола и не понимают, что такое контрольная группа, а сам видишь эффект от Юперио, потому что это доказано в исследовании на 10 тыс пациентах с разницей в комбинированных исходах на пару процентов." (это из другого обсуждения, но вспомнилось)

Data Medicine

04 Nov, 12:17


Бедная медсестра, пала жертвой докмеда.

Data Medicine

04 Nov, 12:16


Как мы в Рассвете Мексидол используем

Ну вы знаете, это препарат относится к классу улучшайзеров.

Сукцинирует митохондрии пока инсульт не пройдет. Говорят, 14 рандомизированных исследований. Хорошо, да? 79 публикаций на PubMed, все из России и примерно везде одни и те же авторы в разных комбинациях.

Во всем мире не хотят лечить инсульт, деменцию и одонтогенную флегмону мексидолом, потому что враги себе и только мы самые умные.

Хорошая иллюстрация к тому, что и 14 рандомизированных исследований могут ничего не доказывать. Это с как с Кагоцелом, там 13,5 тыс человек в исследование включили, впечатляет, но дьявол в деталях. Если изучить дизайн исследования Кагоцела, то оно может отражать только погоду на Юге России и в Армении, где и проходило. С мексидолом, честно, я не разбирался, мне достаточно, что Алексей Эрлих, человек гораздо более близкий к теме, и обнаружил что рандомизированные все хромают, какое без глаза, какое без уха, а то и вовсе без головы. Не доказывают ничего. Такое тоже бывает.

Так я к чему все это. Поднимаюсь в стационар и навстречу медсестра несет пачку мексидола. Торжественно несет, наслаждаясь. Нет, вру, не так все было. Несла-то она его несла, а я сел в лифт и поехал. И только в лифте меня спутники спросили: «в зачем в Рассвете мексидол»?
- Какой мексидол????!!!!
- Да то, что медсестра несла столь торжественно.

Я бегом назад. Зашёл в процедурную, нет мексидола, в комнату хранения лекарств, нет мексидола. Медсестра была занята с пациентом. Пришлось подождать.

- А что у нас тут мексидол делает, не подскажете, для кого это, кто назначил?
- А, все в порядке, это в другой клинике мне невролог назначил, - говорит медсестра, это я для себя., прокапаться.
- Вы же знаете, что такое у нас неприемлемо, уберите пожалуйста с глаз долой и сходите к нормальному неврологу в Рассвете, вы как сотрудник прикреплены к медицинской программе.

Б-ть. Это так мы работаем с персоналом. Но это издержки развития. С открытием второго корпуса средний персонал увеличился в 2,5 раза. А те, кто работают давно, не успели рассказать наши особенности. Нет, рассказать успели, но это не было убедительно. Потому что принятие корпоративной культуры – это не один рассказ о наших правилах и не подпись в отделе кадров. Это каждый день надо видеть, что мексилолов тут не бывает, и главное, надо своими глазами увидеть изумление коллег, которые застали вас при пожирании мексидола.

Data Medicine

03 Nov, 09:56


Я недавно для себя сформулировал, что отношения врачей со статистиками похожи на их отношения с юристами. И те, и другие хорошо объясняют, почему то или иное делать нельзя. А на вопрос, что делать можно, начинают говорить непонятным языком. А на практике оказывается, что все равно все делают то, что делать нельзя. Это совершенно не в упрек юристам или статистикам, скорее в ободрение врачам (и себе самому): не стоит пытаться делать и говорить все правильно, все равно тебе объяснят, что ты ничего не понимаешь.

Это я так готовлюсь к критике текста, который я написал по мотивам протокола исследования HIPEC. На мой взгляд, в методах помимо методологической составляющей должна быть еще и общечеловеческая. В банковском договоре помимо юридического крючкотворства должно быть понятным не юристу языком большими буквами написано, сколько ты будешь платить, сколько переплатишь и что случится, если ты платить не будешь. Так и в методах должно быть написано, что на что умножали, что проверяли и к каким выводам хотели прийти. Это то, чего мне не хватило в этом описании.
Мне кажется, я в итоге немного разобрался и попытался это подытожить. Вышло много букв, поэтому выношу из канала:
https://rpubs.com/drokhotin/fishing-p-values-with-net

Data Medicine

03 Nov, 07:09


В чате комментариев можно почитать обсуждение. В общем, пришли к тому, что объяснение непонятное, но, кажется, в итоге немного разобрались. Насколько метод валиден в данном случае — вопрос.
https://t.me/+MpDJpNUftPRjMWRi

Data Medicine

25 Oct, 10:56


Нашлось уже трое человек, которые прочтут и напишут. Это много. Я тоже напишу, если мои соображения сохранят актуальность.

Data Medicine

25 Oct, 08:29


А вот это уже, пожалуй, котики
https://www.instagram.com/reel/DBTHM5WAgNh/?igsh=MXRvMW41anFuNHZteQ==

Data Medicine

25 Oct, 08:25


Я забыл еще один вариант: в понедельник утром можно совершенно бесплатно почитать обсуждения восхитительных новостей онкологии в замечательном канале прекрасной Анастасии Даниловой. Там, наверняка, вскоре появится и это исследование, если мы не раскритикуем его методологию.
(это еще не котики)

Data Medicine

25 Oct, 08:04


Можно разобрать по схеме доказательной медицины PICO :) Можно еще по какой-нибудь. А можно для начала просто попытаться понять: на какой вопрос пытались ответить авторы и что они делали? Каким было воздействие, каким исход? Как измеряли воздействие, как измеряли исход?

Data Medicine

24 Oct, 17:59


p-fishing как метод?
Вадим Гущин, онколог из Балтимора, предлагает обсудить методологию исследования. Исследование еще не проведено, поэтому обсуждение может иметь и практическую пользу.

Data Medicine

21 Oct, 18:12


Интересное исследование в тему недавних обсуждений стандартизации ЭхоКГ-отчетов, СЭДМ (структурированных электронных медицинских документов), машинного обучения и валидационных когорт. Алгоритм, обученный на 631 284 австралийцах опробовали на 31 141 американцах и он показал неплохие результаты. Конечно, не такие как одноканальная ЭКГ, но почти.
Так что же делал алгоритм? Ставил диагноз аортального стеноза по неполным отчетам ЭхоКГ. Типа, пишите всякую ерунду, не измеряйте диаметр ВТЛЖ, не используйте уравнение непрерывности потока, главное заносите какие-нибудь цифры в СЭМД, а ДЗМ ИИ сам разберется, что там было у пациента.
https://www.jacc.org/doi/10.1016/j.jacadv.2024.101176

Data Medicine

21 Oct, 18:12


ИИ против естественной глупости: 1:0.

Data Medicine

17 Oct, 11:50


Коллеги из ВШО пишут, что ВШО тут ни при чем. Школа Павленко тоже не упоминается в программе курса.
И даже слова онконастороженность там нет :) (а нет, слово есть)
В общем, пиар, маркетинг и пр.

Data Medicine

17 Oct, 10:30


(via https://t.me/ebm_base)
Я уже не студент и не молодой врач, так что так и умру без усиления онконастороженности. Но м.б. кто-нибудь из молодых сходит и наконец расскажет людям, что такое онконастороженность. Я думал, это фантом Минздрава, а тут вроде серьезные люди используют это словечко... ВШО, Школа Павленко... не хухры-мухры.

Data Medicine

07 Oct, 15:20


Учитывая, что в каждой группе было по 20 пациентов, я склоняюсь к мысли, что никакую non-inferiority c margin в 9% показать было невозможно. И отсутствие статистически значимой разницы здесь говорит просто о малой мощности.
В группе МРТ было 7 событий, в группе биопсий 8 событий. Если не считать усреднение по времени, а просто взять годовые риски (никто из наблюдения не выпал), то выйдет 0,35 (95% ДИ 0,14—0,55) и 0,4 (95% ДИ 0,18—0,61). Первый доверительный интервал покрывает 0,4 + 0,09 = 0,49. Т. е. МРТ может быть на 9% хуже, чем биопсии.

Data Medicine

07 Oct, 14:58


А про то, была ли достигнута non-inferiority и достаточна ли была мощность для того, чтобы засчитать этот результат — буду благодарен, если кто-то сможет понять и разъяснить.

Data Medicine

07 Oct, 14:55


Во-вторых, интересно, как оценивалось отторжение. В группе МРТ оно оценивалось с помощью МРТ, а в группе биопсии — с помощью биопсии. Точно? Да, точно. Но если бы вместо МРТ исползовали одноканальную ЭКГ, в группе одноканальной ЭКГ получили бы еще меньше реакций отторжения, потому что их бы вообще не заметили. При сравнении двух вмешательств метод оценки исхода должен быть одинаковым в двух группах. Даже тогда вмешательство может влиять на оценку, но нет так прямо, как в этом случае.

Data Medicine

07 Oct, 14:53


Во-первых, что же удивительного в том, что использование МРТ вместо биопсии снижает число биопсией? А число биопсий вместо МРТ снижает число МРТ. А рандомизация в группу плацебо в исследование статинов снижает использование статинов (на 100%!). Это очень странный результат :)

Data Medicine

07 Oct, 14:49


Но есть здесь одна интересная особенность в плане валидации. Сравнивается некий МРТ-скор с данными биопсии. Вот так выглядт консорт-диаграмма исследования. Обратите внимание на красную стрелку.
На что она показывает? Оптимальные показатели МРТ-критериев оценивали по данным биопсии в первой фазе исследования. То есть это внутренняя валидация. А потом найденные оптимальныепараметры сразу передали для использования в рандомизированном исследовании. То есть как будто внешнюю валидацию пропустили, сразу перешли к рандомизированному исследованию.
Не знаю, плохо ли это, но мне кажется, рискованно. Могли получить невалидные результаты и из-за них не получить подтверждение в РКИ.

Data Medicine

07 Oct, 14:46


И в выводах авторы основной результат (non-inferiority) не указывают, может быть сами не считают его убедительным.

Data Medicine

07 Oct, 14:44


Я получил только одну реакцию на него и вполне с ней согласен: на мой взгляд, его мощность не позволила сделать выводы. Там пишут, что non-inferiority margin была достигнута (в 9% для усредненного по времени риска отторжени 2-й степени), но числа не приводятся. А у кривых выживаемости такие широкие доверительные интервалы, что никак не получается сделать вывод, что одно не хуже друого: кумулятивные риски к концу наблюдения могут отличаться на 10-15%, судя по интервалам.

Data Medicine

07 Oct, 14:36


И хотел вернуться к обсуждению этого исследования. Надеюсь, его авторы не читают наш канал и объясняться не придется.

Data Medicine

07 Oct, 14:29


Из второй статьи мне понравилась цитата:

Failure of authors to report or make the prediction model available will, either through poor reporting or for proprietary reasons,59 also be a clear barrier for independent evaluation, potentially leading to only favourable findings (by the model developers).

Если авторы не предоставляют доступ к своей модели или не описывают ее, в силу ли методологической неряшливости или патентных ограничений, независимая оценка модели, очевидно, будет невозможной, что приведет к публикации только благоприятных сведений о ней (полученных самими разработчиками).

Data Medicine

07 Oct, 14:28


А вторая статья вот: https://www.bmj.com/content/384/bmj-2023-074819
Там тоже есть картинка.

Data Medicine

07 Oct, 14:27


Первая статья вот: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7857818/
Там такая веселая картинка с видами валидации.

Data Medicine

07 Oct, 14:25


В другом канале продуктивно обсудили с авторами исследование диагностического ЭКГ-алгоритма на базе машинного обучения. В связи с этим хочу порекомендовать две статьи о том, что такое валидация прогностических моделей и какая она бывает. Мне кажется, это важно понимать, чтобы не относиться к результатам, полученным методами машинного обучения, как к магии. Они подлежать примерно такой же проверке, как и все остальные клинические инструменты.

Data Medicine

05 Oct, 21:10


А вот полученная с помощью приложения иллюстрация: если взять группу пациентов с мерцательной аритмией и ЧСС от 45 до 90. Исключить тех, у кого исходная ЧСС меньше 60 и давать всем замечательный препарат Плацебиллин, то при достаточно большой выборке (тут 200 человек) будет статистически значимое снижение ЧСС на фоне лечения. Просто за счет исключения небольшой доли тех, у кого исходная ЧСС была низкой.

Data Medicine

05 Oct, 21:00


Хотел написать с картинками про регрессию к среднему. Это довольно фундаментальная вещь для медицины. В частности, она отвечает за многие наши терапевтические иллюзии. Когда нам кажется, что мы помогли пациенту, а на самом деле просто его показатели от крайних возвращаются к средним. В итоге, целый день провозился с разворачиванием сервера для интерактивных приложений shiny. Бесплатный сервер shinyapps позволяет выложить только 5 приложений и мой лимит давно исчерпан. Но теперь у меня свой сервер, и надеюсь я буду делать больше интерактивных объяснялок.
Это первая, не судите строго. Если что-то не работает, пишите в комментариях. То, что немного притормаживает, это нормально.
https://datamedicine.ru/regression-to-the-mean/

Data Medicine

30 Sep, 18:04


Там под этим постом в чате была наваристая дискуссия, интересующимся советую ознакомиться.

2,158

subscribers

276

photos

3

videos