Bioinformatics Institute @bioinforussia Channel on Telegram

Bioinformatics Institute

@bioinforussia


Новости и полезности от Института биоинформатики
@bioinf_career – чат для обсуждения образовательных программ, работы и развития карьеры

Bioinformatics Institute (Russian)

Добро пожаловать в канал "Институт биоинформатики"! Здесь вы найдете свежие новости и полезные материалы об актуальных исследованиях в области биоинформатики. Наш канал предназначен для всех, кто интересуется биоинформатикой, генетикой, молекулярной биологией и другими смежными областями науки. Мы регулярно публикуем информацию о современных методах анализа геномов, последних научных открытиях и событиях, связанных с биоинформатикой. Наши подписчики могут быть уверены, что всегда будут в курсе самых важных событий в мире биоинформатики. Присоединяйтесь к нам, чтобы расширить свои знания и быть в центре научных событий!

Bioinformatics Institute

14 Feb, 13:25


Успешно завершился четвертый запуск программы «Биостатистика и анализ медицинских данных»!
bioinf.me/education/stat/

Выпускники прошли непростой путь от теории вероятностей и классических статистических методов до многофакторного анализа и машинного обучения. Участники также овладели навыками программирования и анализа данных на R и познакомились с различными разделами биостатистики, среди которых:
☁️методология и регуляторика клинических исследований;
☁️непараметрические статистические методы;
☁️анализ выживаемости;
☁️импутация пропущенных значений;
☁️анализ биоэквивалентности;
☁️количественное планирование исследований.

Завершилась программа хакатоном, где студенты попробовали себя в роли биостатистиков в клиническом исследовании, и защитой научных проектов. Вы можете познакомиться с проектами на сайте!

Поздравляем наших замечательных выпускников и приглашаем всех на день открытых дверей трека по биостатистике 5 марта в 19:00 МСК!

#bioinf_openday #bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

10 Feb, 14:32


17 февраля в 19:00 МСК пройдет день открытых дверей программы переподготовки «Биоинформатика для биологов»
bioinf.me/admission

Мы расскажем про особенности поступления в этом году, поговорим об учебных курсах и проектах, послушаем наших выпускников и ответим на ваши вопросы по программе и поступлению — пишите их под этим постом или на [email protected]!
А ещё мы расскажем о других биоинформатических мероприятиях Института: объявим интенсивы на 2025 год и их предварительные даты.

Ссылка на трансляцию будет опубликована отдельным сообщением в канале за несколько часов до события.

До встречи!
#bioinf_openday #bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

07 Feb, 09:48


Открыт набор на весенний запуск интенсива по клинической интерпретации данных NGS!
bioinf.me/education/workshops/clin | дедлайн регистрации — 14 апреля

Занятия пройдут с 22 апреля по 28 июня и включают:
💮Знакомство с основами биоинформатического анализа данных NGS;
💮Определение и классификацию эффектов мутаций;
💮Анализ данных в геномном браузере;
💮Работу с биомедицинскими базами данных;
⭐️Выпускной проект — интерпретация учебных клинических кейсов.

Курс подойдет тем, кто хочет узнать все этапы генетического исследования и освоить инструменты клинического анализа данных NGS.
Подробное описание лекций доступно по ссылке, а если вы хотите поближе познакомиться с профессией клинического интерпретатора — посмотрите открытую лекцию от авторов интенсива. Для участия необходимо пройти вступительный курс на Stepik до 14 апреля (23:50 МСК) и заполнить анкету участника!

Количество мест в группе ограничено. В случае, если группа наберётся до 14 апреля, возможно более раннее закрытие набора.

P.S. В конце февраля состоится открытая лекция, посвященная генетическому скринингу! Скоро анонс, не пропустите!


#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

31 Jan, 10:58


Опубликована запись лекции Вениамина Фишмана «Языковые модели ДНК: разговор на языке геномов»
bioinf.me/guests

Вениамин рассказал об эволюции подходов машинного обучения, использующихся при решении биологических задач, и поделился собственным опытом разработки языковых моделей, способных работать с последовательностью ДНК (GENA-LM). Запись встречи доступна на сайте, приятного просмотра!

#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute #полезное

Bioinformatics Institute

29 Jan, 15:35


Магистерская программа «Вычислительная биология и биоинформатика» НИУ ВШЭ открыла конкурс «Биоинформатика — шаг в будущее»!
spb.hse.ru/stepinbio | 1 февраля — 31 марта

Цель конкурса — помочь будущим абитуриентам получить максимальный балл на вступительном экзамене и подготовиться к приемной кампании. Участники проверят свои знания математики, программирования, биологии и физики, а также свои аналитические способности и логическое мышление.
Победители и призеры Конкурса могут получить привилегии при поступлении на магистерскую программу «Вычислительная биология и биоинформатика». Спешите присоединиться!

#возможности

Bioinformatics Institute

27 Jan, 11:36


Стартовал прием заявок на годовую программу переподготовки «Биоинформатика для биологов» 2025/26!
bioinf.me/admission

Чтобы поступить на программу, необходимо:
1. Подать заявку до 16 марта 23:59 МСК;
2. Пройти вступительный курс на Stepik до 30 марта 23:59 МСК;
3. Решить онлайн-тест 3 апреля в 19:00 или 6 апреля в 13:00 МСК;
4. Принять участие в собеседовании (апрель — май).

Стоимость обучения — 81 000 рублей за семестр. Абитуриенты, прошедшие все этапы отбора, смогут претендовать на грант, покрывающий часть стоимости обучения.

Обучение длится с сентября по июнь, лекции проходят по субботам и в вечернее время 1-2 будних дней, так что можно совмещать с работой и учебой. Формат занятий — онлайн (Zoom), а значит, учиться можно из любой точки мира!

Подробнее о программе читайте на сайте bioinf.me/admission, а темы научных работ студентов вы найдете здесь: bioinf.me/education/projects.
Также напоминаем про наш карьерный чат t.me/bioinf_career, где обсуждают много всего интересного и делятся вакансиями.

Ждем ваших заявок и желаем удачи!
#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

22 Jan, 14:05


Зимний лекторий по мультиомиксным технологиям стартовал:
bioinf.me/open_winter

В аудитории Института биоинформатики собралось более 50 слушателей. За первые два дня они познакомились с основами обработки данных с помощью Python и R, узнали о методах секвенирования и анализа генома, а также обсудили научный поиск и методологию исследований.

Мы невероятно рады проводить эти встречи оффлайн! А для тех, кто не смог присоединиться лично, мы выложим записи лекций на сайте Института по окончании лектория.

Следите за обновлениями и до встречи на следующих мероприятиях!

#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

08 Jan, 06:59


Приглашаем на Зимний Лекторий по мультиомиксным технологиям, который пройдет в Санкт-Петербурге!
bioinf.me/open_winter | 20 — 25 января, очно

Спешим пригласить на первое открытое мероприятие 2025 года, посвященное введению в область мультиомиксных технологий! Полина Кучур, преподаватель ИТМО и м.н.с. ЦИН РАН, расскажет обо всех этапах цикла работы биоинформатика: от формулировки биологической гипотезы до ее проверки с использованием современных методов. В ходе теоретических и практических занятий вы познакомитесь с разнообразием омиксных данных, а некоторые их виды научитесь обрабатывать и анализировать.
Лекторий подойдет слушателям с базовыми знаниями биологии — на уровне программы старших классов школы или Летнего лектория Института биоинформатики. Регистрация открыта до 15 января 23:50 МСК (количество мест ограничено). Записи лекций будут выложены на сайт Института после окончания мероприятия.

Расписание:
🟢20 января, Пн 18:30–20:30 — открытие лектория, лекция «Омиксные технологии и методы обработки данных c помощью Python и R»
🟢21 января, Вт 19:00–20:30 — лекция «Методы геномики»
🟢22 января, Ср 19:00–20:30 — лекция «Методы транскриптомики»
🟢23 января, Чт 19:00–20:30 — лекция «Методы исследования метагенома»
🟢24 января, Пт 19:00–20:30 — лекция «Методы протеомики»
🟡25 января, Сб 12:00–15:00 — практическое занятие по анализу данных RNA-seq
🟡25 января, Сб 16:00–19:00 — практическое занятие по анализу протеома

Ждем вас!
#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

31 Dec, 18:42


Институт биоинформатики поздравляет с Новым годом!
bioinf.me

Наступило 31 декабря, и мы подводим итоги уходящего года. Для удобства мы собрали их в видео, а текстом хотим продублировать благодарности всем, без кого это было бы невозможно ❤️:
преподавателям и ассистентам, которые вкладывают всю душу в обучение наших студентов;
руководителям проектов, которые готовы делиться знаниями и опытом;
выпускникам и друзьям Института, которые помогают в собеседованиях, участвуют в жизни Института и просто рядом;
участникам нашего карьерного чата @bioinf_career, которые выкладывали вакансии, обсуждали проблемы и варианты решения, делились опытом, ссылками и советами;
спонсорской поддержке BIOCAD, которая помогает нам продолжать делать то, что получается у нас лучше всего!

Спасибо, что были с нами в этом году! Желаем в новом 2025 увеличения Хирша, больше интересных коллабораций, одобрения всех заявок на гранты, интересных предложений по работе и стажировкам, и сил со всем этим справиться. Ура!

P.S. А запланировать начало вашего года с Институтом вы можете уже сейчас! 20 января начнется наш зимний лекторий, зарегистрироваться можно до 15 января: bioinf.me/open_winter
P.P.S. Набор на годовую программу по биоинформатике 2025/2026 стартует в середине января. Следите за новостями ;)

#bioinf_online #bioinf_education

Bioinformatics Institute

31 Dec, 07:21


Завершилась основная часть программы переподготовки по биостатистике | bioinf.me/stats

За время обучения студенты освоили программирование на R, изучили методы классической биостатистики и машинного обучения, разобрались в тонкостях клинической регуляторики, реализовали мини-проекты на основе открытых данных, приняли участие в круглом столе по карьере в биостатистике и представили первые результаты работы над выпускными проектами.

Впереди январь — время завершения работы над проектами и хакатона по индустриальной биостатистике. А в качестве новогоднего подарка мы подготовили для студентов мини-курс по мета-анализу!

Желаем нашим студентам сил и успехов на финишной прямой!

#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

23 Dec, 14:31


Через полтора часа начнется лекция «Эффект плацебо: ну и кто здесь пустышка?»
23 декабря, 19:00 МСК | bioinf.me/guests

Напоминаем, что сегодня в 19:00 состоится встреча с Екатериной Фокиной, на которой вы узнаете о том, как связаны экзорцизм и клинические исследования, можно ли заметить эффект плацебо на уровне структур мозга, и, наконец, о роли самообмана точки зрения эволюции.

Спешите присоединиться!
Регистрация: bioinforussia.timepad.ru/event/3164994/

#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

20 Dec, 14:22


Напоминаем об открытой лекции: «Эффект плацебо: ну и кто здесь пустышка?»
23 декабря, 19:00 МСК | bioinf.me/guests

Уже в этот понедельник Екатерина Фокина расскажет об эффекте плацебо: о том, как связаны экзорцизм и клинические исследования, как эффект плацебо заметен на уровне мозга, и, наконец, о том, зачем нам самообман с эволюционной точки зрения.

Ждем вас на лекции!
Регистрация: bioinforussia.timepad.ru/event/3164994/

#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

19 Dec, 12:25


Открыт набор на Школу молекулярной и теоретической биологии!
molbioschool.org

До 31 декабря 2024 года школьники могут подать заявку на участие в ШМТБ-2025. Это шанс погрузиться в мир науки и попробовать себя в настоящих исследованиях. Участники Школы будут слушать лекции, осваивать современные научные методы, учиться проводить расчёты и проверять гипотезы в области молекулярной и теоретической биологии.

📍 Где: Назарбаев Университет, Астана, Казахстан
🗓 Когда: 28 июня — 14 июля 2025 года

Подробности и регистрация: molbioschool.org/ru/participants/admission/

Расскажите об этой возможности школьникам, которым интересны биология и биоинформатика! 😉

#полезное #возможности

Bioinformatics Institute

17 Dec, 11:39


Рассказываем о нашем партнёре — проекте Sci_Career!

Sci_Career помогает с поиском работы и стажировок как в России, так и в других странах. Ежедневно на канале вы найдете:

- Подборки вакансий в области науки, образования, просвещения и научных коммуникаций и других областей;

- Релевантные позиции для PhD и Postdoc со всего мира;

- Публикации эксклюзивных вакансий в научной и научно-технической сфере;

- Анонсы мероприятий, стажировок, грантов и конференций;

- Полезные гайды по написанию статей и их публикации, составлению резюме и CV, прохождению собеседований и адаптации в новой лаборатории.

А еще Sci_Career собрал каналы дружественных проектов в папку, чтобы вы были в курсе актуальных карьерных возможностей!

Telegram: @Sci_Career
VK: @Sci_Career

Bioinformatics Institute

16 Dec, 14:32


Открытая лекция: «Эффект плацебо: ну и кто здесь пустышка?»
23 декабря, 19:00 МСК | bioinf.me/guests

Провожаем 2024 год вместе с Екатериной Фокиной — медицинским экспертом департамента клинической разработки BIOCAD и выпускницей программы переподготовки по биостатистике Института биоинформатики!
Лекция будет посвящена эффекту плацебо — одной из самых обсуждаемых тем последних десятилетий. Екатерина расскажет:
- Как связаны экзорцизм и клинические исследования?
- Зачем эволюция «изобрела» самообман?
- Как эффект плацебо заметен на уровне структур мозга?

Присоединяйтесь!
Регистрация: bioinforussia.timepad.ru/event/3164994/

#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute #полезное

Bioinformatics Institute

09 Dec, 15:47


Напоминаем о лекции Вениамина Фишмана «Языковые модели ДНК: разговор на языке геномов»
Регистрация | 9 декабря 19:00

Напоминаем, что уже через 10 минут начнется открытая лекция, посвященная языковым моделям. На ней вы узнаете о том, как развивались методы машинного обучения для решения биологических задач, а также познакомитесь с GENA-LM — языковой моделью ДНК.

Регистрация по ссылке: bioinforussia.timepad.ru/event/3144621/
Спешите быть!

#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

06 Dec, 10:17


Открытая лекция Вениамина Фишмана «Языковые модели ДНК: разговор на языке геномов»
Регистрация | 9 декабря 19:00

Напоминаем, что уже в следующий понедельник состоится открытая лекция, посвященная языковым моделям. На этой встрече Вениамин расскажет о том, как развивались методы машинного обучения для решения биологических задач и покажет, как работать с GENA-LM — языковой моделью ДНК.

Мероприятие пройдет онлайн, регистрация по ссылке: bioinforussia.timepad.ru/event/3144621/
Присоединяйтесь!

#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute #полезное

Bioinformatics Institute

02 Dec, 16:01


9 декабря в 19:00 состоится открытая лекция, посвященная языковым моделям ДНК!
Регистрация | bioinf.me/guests

Уже в следующий понедельник Вениамин Фишман, сотрудник института AIRI, расскажет об эволюции подходов машинного обучения, использующихся в решении биологических задач. На лекции он поделится собственным опытом разработки языковых моделей, способных работать с последовательностью ДНК, и продемонстрирует, как скачать, настроить и использовать модель GENA-LM.
Приходите, чтобы узнать, какие задачи можно решать с помощью таких технологий!

Регистрация доступна по ссылке: bioinforussia.timepad.ru/event/3144621/
Ждем вас!

#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute #полезное

Bioinformatics Institute

29 Nov, 11:05


Интенсив по клинической интерпретации данных NGS завершён!
bioinf.me/education/workshops/clin

9 ноября студенты отметили окончание обучения успешной защитой выпускных клинических кейсов. За два месяца они освоили применение критериев ACMG (и не только), научились определять патогенность вариантов, работать с IGV и Genomenal, а также узнали основы биоэтики и биоинформатического анализа данных.
Мы гордимся каждым из наших выпускников и благодарим их за активное участие!

P.S.: Новости о новом наборе на этот интенсив ожидаются зимой 2025 года ;)
#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

25 Nov, 09:21


Делимся записью лекции Александры Мамчур «Нельзя так просто взять и применить AlphaFold»:
bioinf.me/guests

Спешим сообщить, что мы выложили запись встречи на сайт Института! Александра рассказала о том, как устроен AlphaFold, как его используют для решения задач структурной биологии, а также обсудила существующие ограничения модели.
Приятного просмотра!

#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

04 Nov, 14:01


Сегодня, в 19:00 МСК, состоится лекция Ивана Бутенко «До генома, после генома»
bioinf.me/guests

Лекция будет посвящена протеомике, масс-спектрометрии и использованию этих технологий для исследования маркеров здоровья человека. Встреча состоится онлайн, регистрация по ссылке: bioinforussia.timepad.ru/event/3096277
Ждем всех!

#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

01 Nov, 11:48


В понедельник, 4 ноября, состоится открытая лекция, посвященная протеомике:
4 ноября в 19:00 | bioinf.me/guests

Приглашаем на лекцию Ивана Бутенко, на которой вы узнаете о развитии методов изучения молекулярных основ здоровья, познакомитесь с принципами масс-спектрометрии и протеомного анализа, а также рассмотрите задачи, которые решаются с помощью этих технологий.

Встреча состоится онлайн, на платформе Zoom. Регистрация по ссылке: bioinforussia.timepad.ru/event/3096277
Ждем вас на лекции!

#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

26 Oct, 12:26


«До генома, после генома»: приглашаем на открытую лекцию о протеомике!
4 ноября в 19:00 | bioinf.me/guests

Иван Бутенко, сотрудник НИИ СБМ, расскажет об эволюции знаний о молекулярных основах здоровья и инструментов для его изучения. Слушатели познакомятся с основами масс-спектрометрии и протеомного анализа, узнают, какие принципы физики, биологии, математики и химии лежат в основе этих методов, и на какие вопросы можно ответить с помощью этих технологий.

Присоединяйтесь! Регистрация на лекцию доступна по ссылке: bioinforussia.timepad.ru/event/3096277

#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

22 Oct, 13:15


В продолжении дискуссии о Нобелевской премии приглашаем на встречу BIOCAD Guest Club, посвященную достижениям в области химии и машинного обучения | 24 октября, 19:30 МСК

Павел Яковлев (вице-президент по ранней разработке и исследованиям, BIOCAD) и Антон Чугунов (с.н.с. ИБХ РАН, главный редактор «Биомолекулы») обсудят на встрече:

1. За какие открытия была присуждена Нобелевская премия по химии в 2024 году?
2. Почему премия по химии присуждена программистам?
3. Как машинное обучение влияет на биохимию и изменит ли оно методологию научных исследований?
4. Какие существуют перспективы использования этих технологий в фармацевтике и медицине?

Модератор встречи — Анна Владимирова, директор Департамента научного развития BIOCAD.

Прямая трансляция пройдет в VK, присоединяйтесь!

#bioinf_events @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

21 Oct, 12:12


Сегодня в 19:00 состоится открытая лекция Александры Мамчур: «Нельзя так просто взять и применить AlphaFold»
bioinf.me/guests | Регистрация

На встрече вы узнаете, в чем сложность предсказания структуры белка, какие конкретные задачи можно решать с помощью AlphaFold и что невозможно сделать с его помощью на текущий момент.

Регистрация доступна по ссылке, встреча будет проходить на платформе Zoom.

Ждем вас!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

18 Oct, 11:13


Нельзя так просто взять и применить AlphaFold:
bioinf.me/guests | 21 октября, 19:00

На этой открытой лекции Александра Мамчур расскажет о роли AlphaFold в решении задач структурной биологии: ответит на вопросы о том, почему предсказание структуры белка представляет собой сложную вычислительную задачу, какие конкретные проблемы способен решать AlphaFold3, а также обсудит его ограничения и проблемы, с которыми этот алгоритм справиться пока не может.

Приходите на лекцию, это хороший шанс узнать больше про технологию, отмеченную нобелевской премией: bioinforussia.timepad.ru/event/3074250

Спешите быть!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

16 Oct, 23:00


Делимся новостями и статистикой набора годовой программы по биоинформатике:
bioinf.me/education/program

6 сентября состоялась очная встреча студентов с кураторами и преподавателями Института, во время которой они познакомились друг с другом и отметили начало учебного года.
На следующий день 60 студентов программы профессиональной переподготовки по биоинформатике начали обучение. Сейчас, к середине семестра, они уже овладели необходимыми навыками для работы с командной строкой, выполнили свой первый учебный проект по статистике и визуализации данных в R, начали изучать Python, Git и базовые биоинформатические алгоритмы. Все это – подготовка к практикуму по анализу данных NGS, который начнется уже на этой неделе!

Хотим поделиться с вами статистикой зачисления на программу в этом году: лишь 32 из 60 студентов попали на программу с первой попытки, так что не стоит сдаваться, если вам не удалось поступить с первого раза — мы будем рады вашим заявкам на следующий набор и встречам на собеседованиях весной!
А если вам интересно, как лучше подготовиться к поступлению – рекомендуем ознакомиться со страницей годовой программы, а также списком онлайн-курсов Института биоинформатики!
Желаем хорошего дня!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

10 Oct, 09:01


21 октября в 19:00 cостоится открытая лекция, посвященная AlphaFold:
bioinf.me/guests

Вчера алгоритм предсказания трёхмерных структур биомолекул AlphaFold получил нобелевскую премию. Однако действительно ли он является панацеей в мире структурной биоинформатики?
Александра Мамчур, сотрудник кафедры биофизики МГУ, расскажет, почему предсказание структуры белка представляет собой сложную вычислительную задачу, какие конкретные проблемы способен решать AlphaFold3, а также обсудит ограничения и вопросы, для решения которых эта технология пока остаётся менее эффективной.

Регистрация на лекцию доступна по ссылке: bioinforussia.timepad.ru/event/3074250


Ждем всех!
YouTube: Bioinformatics Institute
#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

03 Oct, 10:40


Обучение на интенсиве по алгоритмической биоинформатике уже началось:
bioinf.me/education/inf

На этом курсе, посвящённом вычислительной биологии, учится 21 студент из 11 городов мира. В минувшую субботу они сделали первые шаги в изучении биоинформатики, прослушав лекции по организации клетки, методам молекулярной биологии и технологиям секвенирования. Впереди их ждут занятия по молекулярным основам наследственности, статистике, биоинформатическим алгоритмам и, наконец, работа над выпускным проектом — созданием пайплайна для решения биомедицинской задачи.

Мы очень рады вновь запустить наши образовательные программы для информатиков, желаем студентам успехов и с нетерпением ждём результатов их выпускных работ!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

27 Sep, 09:14


Bioinformatics Institute pinned «С чего начать погружение в мир биоинформатики? stepik.org/org/bioinf Отвечаем на один из самых популярных вопросов в нашем карьерном чате: у Института биоинформатики более 20 открытых курсов на образовательной платформе Stepik, с которых вы можете начать…»

Bioinformatics Institute

27 Sep, 09:09


С чего начать погружение в мир биоинформатики?
stepik.org/org/bioinf

Отвечаем на один из самых популярных вопросов в нашем карьерном чате: у Института биоинформатики более 20 открытых курсов на образовательной платформе Stepik, с которых вы можете начать ваш путь!

Курсы охватывают темы от молекулярной биологии до программирования на Python, например:
❤️ Молекулярная биология и биология клетки — Молекулярные основы функционирования живых клеток, передачи и реализации наследственной информации;
❤️ Биотехнологии: генная инженерия — Базовые методы генной инженерии: получение рекомбинантной ДНК, ПЦР, молекулярное клонирование, синтез генов, белков и геномов;
❤️ Введение в Linux — Знакомство с операционной системой Linux, командной строкой и работой на удаленном сервере;
❤️ Введение в NGS — Основные типы секвенирования, области их применения, контроль качества и первые шаги в обработке данных NGS;
❤️ Молекулярная филогенетика — Основы филогенетического анализа последовательностей нуклеиновых кислот или белков;
❤️ Программирование на Python — Базовые понятия языка Python: Объекты, операторы, функции, библиотеки и др.;
❤️ Основы программирования на R — Первые шаги в программировании на R для анализа данных: операции над векторами и матрицами, библиотека dplyr;
❤️ Управление вычислениями — Linux контейнеры, Docker и инструменты автоматизации вычислений.

Нравится решать сложные алгоритмические проблемы? Попробуйте свои силы на заданиях прошедшего контеста по биоинформатике!

Больше открытых курсов вы найдете по ссылке: stepik.org/org/bioinf
Приятной учебы!

YouTube: Bioinformatics Institute
#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

21 Sep, 14:11


10 сентября стартовал интенсив по клинической интерпретации данных NGS:
bioinf.me/education/workshops/clin

Студенты уже повторили основы молекулярной биологии, узнали с чего начинается анализ клинического кейса, а также как проходит секвенирование и биоинформатическая обработка данных NGS. Сегодня участники учатся работать с геномным браузером IGV: тренируются определять эффект, генотип и аллельный баланс вариантов, что в дальнейшем пригодится при анализе выпускного клинического кейса!

Для вас мы приготовили задачу по генетике: как вы думаете, какой тип наследования изображен на схеме? 😉

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

17 Sep, 10:04


На прошлой неделе началась программа переподготовки по биостатистике и анализу медицинских данных:
bioinf.me/education/stat

Студенты уже послушали первые лекции по теории вероятностей, методологии доказательной медицины, программированию на R и визуализации данных. Впереди ещё 5 насыщенных месяцев, а для того, чтобы задать общий вектор обучения, мы поделились нашими «10 заповедями биостатистика», которые могут помочь найти свои внутренние ориентиры в этой непростой профессии!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

31 Aug, 16:38


Регистрация на интенсив по клинической интерпретации данных NGS 2024 завершена: bioinf.me/education/workshops/clin

Из-за ограниченного числа мест мы вынуждены закрыть регистрацию на курс досрочно, но уже этой зимой сообщим о датах следующего запуска!

Не переключайтесь!
#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

29 Aug, 06:29


Напоминаем о регистрации на интенсив по клинической интерпретации данных NGS:
bioinf.me/education/workshops/clin | 10 сентября — 2 ноября

Курс будет полезен врачам-генетикам, начинающим клиническим интерпретаторам и всем, кто интересуется анализом данных секвенирования. На интенсиве вы научитесь находить и классифицировать мутации, ассоциированные с фенотипом пациента: освоите работу с геномными браузерами, биомедицинскими базами данных, а также узнаете, как применять критерии ACMG. Помимо этого, разберетесь в этических аспектах клинической интерпретации и посетите лекции приглашенных специалистов.
Выпускной проект — анализ учебного клинического кейса. По результатам обучения выдается удостоверение о повышении квалификации или сертификат участника.

Чтобы присоединиться необходимо:
- Набрать 59 баллов на вступительном курсе на Stepik (займет около 4 часов)
- Заполнить анкету участника до 31 августа 23:50 МСК. Доступ к анкете откроется после прохождения вступительного курса.

А если вы хотите узнать больше о работе клинического интерпретатора — посмотрите открытую лекцию авторов интенсива:
- Генетический детектив: интерпретация NGS-данных в диагностике наследственных болезней | Катерина Данько и Полина Богайчук

Спешите быть!
#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

22 Aug, 13:45


Вакансии из чата Института биоинформатики:
t.me/bioinf_career

Делимся актуальными предложениями в области биоинформатики! В списке позиции как для PhD и научных сотрудников, так и для разработчиков ПО, биостатистиков и молекулярных генетиков:

⚫️telegra.ph/Podborka-vakansij-chata-Instituta-bioinformatiki-08-22

Больше возможностей можно найти по хештегу #вакансии в чате Института: t.me/bioinf_career 😉

#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

15 Aug, 10:30


Продолжается набор на интенсив по клинической интерпретации данных NGS: bioinf.me/education/workshops/clin

Интенсив пройдет с 10 сентября по 2 ноября и подойдет тем, кто хочет научиться интерпретировать данные экзомного или геномного секвенирования. На курсе вы научитесь:
🟡находить генетические причины моногенных заболеваний;
🟡классифицировать однонуклеотидные замены и CNV по критериям ACMG/AMP и их модификациям;
🟡работать с геномными браузерами, популяционными и медико-биологическими базами данных;
🟡оформлять заключение по результатам анализа.
В ходе обучения вы будете работать над интерпретацией учебных клинических кейсов и сможете применять новые знания на практике!

По итогам обучения выдается сертификат об участии. Для получения удостоверения о повышении квалификации необходимо выполнить 50% домашних заданий и защитить выпускной проект.

Чтобы принять участие в интенсиве — пройдите вступительный онлайн курс и заполните анкету до 31 августа 23:50 МСК.
Ждем вас!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

04 Aug, 07:06


Последний день приема заявок на программу повышения квалификации «Алгоритмическая биоинформатика 2.0»!
bioinf.me/education/inf | 28 сентября — 14 декабря

На курсе вы познакомитесь с вычислительной биологией и анализом биомедицинских данных и изучите:
- Основы молекулярной биологии;
- Алгоритмы в биоинформатике;
- Введение в статистический анализ данных;
- Работу с геномными утилитами;
- Разработку пайплайнов для анализа данных NGS;
А в конце обучения защитите выпускной проект.

Для участия в программе необходимо заполнить анкету до 4 августа 23:59 МСК, решить вступительный тест 9 или 11 августа и пройти онлайн-собеседование в сентябре.

Присоединяйтесь!
#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

01 Aug, 13:08


Напоминаем про регистрацию на программу повышения квалификации «Алгоритмическая биоинформатика 2.0»!
bioinf.me/education/inf | Дедлайн регистрации: 4 августа 23:59 МСК

Курс предназначен для тех, кто хочет познакомиться с вычислительной биологией и анализом биомедицинских данных, и включает такие темы, как:
- Основы молекулярной биологии;
- Алгоритмы в биоинформатике;
- Введение в статистический анализ данных;
- Работа с геномными утилитами;
- Разработка пайплайнов для анализа данных NGS;
А также дополнительные лекции, посвященные разнообразию биоинформатических задач в науке и индустрии и навыкам, необходимых для работы в этой сфере.
Завершится обучение выполнением выпускного проекта, в ходе работы над которым учащиеся применят полученные знания на практике.

Для участия необходимо заполнить анкету до 4 августа 23:59 МСК, решить вступительный тест 9 или 11 августа и пройти онлайн-собеседование. Подробное описание программы обучения и вступительных мероприятий доступно на сайте: bioinf.me/education/inf

Успейте подать заявку!
#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

29 Jul, 10:00


Завершился Летний лекторий 2024 по молекулярной биологии и биоинформатике!
bioinf.me/open_summer | Записи лекций

В этой серии открытых лекций слушатели познакомились с основами молекулярной биологии, разнообразием биомедицинских проблем и вычислительных методов для их решения. Преподаватели лектория рассказали про методы анализа структуры хроматина, поиск причин генетических заболеваний, предметы изучения метагеномики и протеомики, а также про применение биоинформатики при разработке лекарств и в онкологии.
Записи лекций доступны на нашем канале. Также мы открыли доступ к заданиям по темам лекций, с помощью которых вы можете закрепить материал.
Благодарим участников за активность на занятиях и ждем на грядущих мероприятиях Института!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop
@bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

25 Jul, 17:25


Завтра последний день регистрации на онлайн-программу переподготовки «Биостатистика и анализ медицинских данных» 2024/25: bioinf.me/education/stat 

Программа ориентирована на людей, планирующих работу в индустрии или научную карьеру, с базовыми навыками статистического анализа на языке R и включает модули:
1. Методология и регуляторика
2. Специфика медицинских данных
3. Статистика и анализ данных
4. Программирование

Успейте подать заявку до 26 июля, 21:00 МСК!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop
@bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

19 Jul, 12:50


До 26 июля открыт набор на программу переподготовки «Биостатистика и анализ медицинских данных»: bioinf.me/education/stat

Участники пройдут путь от изучения классических методов статистического анализа до современных методов машинного обучения, научатся программировать и визуализировать данные с помощью R, познакомятся с основами методологии и регуляторики клинических исследований, будут работать над научными проектами и поучаствуют в хакатоне по индустриальной биостатистике!

Чтобы принять участие в программе вам нужно:
– подать заявку до 26 июля, 21:00 МСК
– пройти вступительное тестирование 27 июля или 3 августа

Конец августа и начало сентября посвящены самостоятельной работе, с 11 сентября и до конца декабря занятия будут проходить по вечерам сред и субботам в Zoom, в январе участники завершают работу над научными проектами.

Подробнее о программе и о том, как проходит обучение мы рассказывали на дне открытых дверей и в статье на Биомолекуле.

Успейте подать заявку!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop
@bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

17 Jul, 16:02


Приглашаем на новую программу повышения квалификации Института «Алгоритмическая биоинформатика 2.0»!
bioinf.me/education/inf | Дедлайн регистрации: 4 августа

Мы рады объявить набор на программу, посвященную алгоритмической биоинформатике, которая пройдет онлайн с 28 сентября по 14 декабря!
Этот курс предназначен для людей с техническим образованием, которые хотят познакомиться с вычислительной биологией и анализом данных на практике. Обучение включает в себя основы молекулярной биологии, статистики, а также реализация алгоритмов и создание пайплайнов для анализа данных NGS. На дополнительных лекциях преподаватели познакомят с разнообразием задач, которые решает биоинформатика, и расскажут о навыках, необходимых для работы в этой сфере. По окончании основной части обучения студенты закрепят полученные знания выполнением выпускного проекта.

Для участия в программе необходимо заполнить анкету до 4 августа 23:59МСК, решить вступительный тест 9 или 11 августа и пройти онлайн-собеседование. Стоимость курса составляет 29 000 рублей. Студенты очной формы обучения могут претендовать на грант, а выпускникам программ переподготовки и повышения квалификации Института биоинформатики предоставляется скидка 10%.

Ждем ваших заявок!
#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

16 Jul, 15:39


Делимся записью лекции Дмитрия Буга «Секвенирование ДНК в онкологии»:
bioinf.me/guests | youtube.com/watch?v=6kRvLCvlWOg

Лекция посвящена анализу данных NGS опухолей ткани, интерпретации результатов секвенирования, включая анализ мутаций в кодирующих и некодирующих областях генома, а также методы оценки патогенности и онкогенности мутаций.

А еще, мы напоминаем про интенсив по клинической интерпретации данных NGS. На интенсиве вы научитесь работать с данными вариант-коллинга, узнаете, как определять патогенность мутаций, проанализируете учебный кейс и вынесете заключение. Регистрация открыта до 31 августа.

Приятного просмотра и ждем вас на наших мероприятиях!

#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute

08 Jul, 09:27


Начинается вторая и заключительная неделя открытого лектория:
bioinf.me/open_summer

Слушатели уже освоили основы наследственности, клеточной биологии, методы секвенирования и анализа ДНК. На этой неделе они узнают, как и зачем проводится анализ экспрессии генов, какие вопросы решают протеомика и метагеномика, как машинное обучение применяется при создании лекарственных препаратов, и каким образом биоинформатика помогает в решении онкологических задач.
Завершится лекторий открытым столом, на котором будут обсуждаться карьерный путь и навыки современного биоинформатика.
Ждем вас на лекциях!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute