Научная жизнь Эльмиры

С Новым годом🎄

Этот дрип приехал из Москвы в Египет, из Египта в Австрию, из Австрии в Калифорнию, а из Калифорнии попал в Техас, чтобы мое pre-Christmas утро началось с кофе.

Просто всех моих однокурсников разбросало по миру.

Калифорния: снег, водопады, осенние листья и бушующий океан.

А теперь время для отдыха.

Случайности.

Одна из первых моих статей была опубликована в в 2019 году в журнале Frontiers in Immunology.

У статьи было открытое ревью, а одним из рецензентов была Rachel Rau.

В 2022 году, когда я подала заявку в свою нынешнюю лабораторию, только к моменту интервью я поняла, что Rachel Rau - профессор, ассоциированная с лабораторией.

К моменту моего приезда в Хьюстон, она получила отдельную лабораторию и уехала в Сиэтл.

Сегодня Rachel делала plenary доклад (очень престижно!), рассказав о результатах своего клинического испытания, только что опубликованного в NEJM.

В Сан-Диего на ASH ❤️

Очень воодушевлена и готова наполняться знаниями.

А еще у нас в лаборатории был potluck в честь дня благодарения. Это когда каждый человек приносит свое блюдо в стол. Интересная шутка, так как лаба многонациональная. Была индийская, китайская, американская, корейская, мексиканская еда 🎉

ASH крупнейшая конференция по гематологии. Масштаб впечатляет.

Вот как это было в прошлом году :)

Наконец-то рассказала о том, как съездила на самую большую конференцию по гематологии ASH в Калифорнию.

Очень тяжело найти время и мотивацию на монтаж видео, хотя это дело мне приносит удовольствие.

Получила свой бейдж для участия в конференции ASH в Сан Диего. Ничего не презентую, буду слушать и общаться.

Завела много полезных знакомств в прошлый раз, получила от профессоров новые протоколы, теперь хочу встретиться и обсудить результаты, а также поделиться проблемами, с которыми столкнулась.

Еще хочу заехать в Стэнфорд, если получится договориться об экскурсии.

Переезд в другую страну не помогает от таких проблем

Когда я вижу, какие постдоки приезжают к нам в BCM делать доклады, я ловлю необъятный такой импостор. Проходит, работаю дальше, осадочек останется.

Вот, например, человек напечатал статью в nature первым автором за PhD, а потом еще одну за постдок. И так по мелочи еще десяток статей.

Не выиграла лучший постер, но многим он очень понравился. В следующем году, надеюсь, буду делать доклад.

Чудесная локация для ретрита. Почти отпуск 😀

Напечатала свой первый Американский постер.

Почему-то он мне кажется таким огромным, видимо уже давно не печатала и подзабыла.

Еду завтра на ретрит центра в Галвестон - буду 2 дня у океана строить новые коллаборации и приятно проводить время в шикарном отеле.

Департамент, главной которого является моя PI, очень любит Хеллоуин.

Каждый год Лабы наряжаются и пытаются завоевать награду за лучший костюм.

Наша тема была: Lab Olympics и люди наряжались в:

Boxing KO mice - боксирующие КО мыши
Stem Clones Racing - Забег клонов стволовых клеток
Pipette fencing - фехтование пипетками
Pipette sharpshooting - стрельба из пипетки

Я выбрала себе костюм CRISPR арбалетчика, так как редактирую геномы каждую неделю.

Вчера пришлось прерваться от эксперимента и вырезать тыкву на конкурс департамента.

Удобный тул для «чтения» статей и приятная информация для любителей кофе на канале Человек Наук

Когда сидела и придумывала картинку вместо того, чтобы работать ..

Ура! Первая публикация с новой аффилиацией, хоть пока и не исследовательская статья. Это был замечательный опыт: сжатые сроки, новый для меня формат и прекрасная статья, на которую нужно было сделать обзор.

https://aacrjournals.org/cancerdiscovery/article-abstract/14/10/1768/748594/Can-Ruxolitinib-Crash-TET2-and-IDH2-Driven-Clonal?redirectedFrom=fulltext

Ходила в клинику MD Anderson за анонимным образцом крови от пациента с рецидивом острого миелоидного лейкоза.

У нас очень любят поддерживать Хьюстонскую команду по бейсболу - Астрос.

В прошлом году была немного в шоке, когда увидела количество в людей в футболках клуба.

Строила маршрут для поездки на работу и случайно открыла список, который составляла при подаче на постдок.

Я, честно говоря, мало себе представляла, что и где находится в США, поэтому сначала добавила свои варианты на карту 😀

В Dana Farber я решила не подавать, так как в интересующей меня лабе уже было 10+ постдоков.

Максимально смешно, что я лет 5 знала про MD Anderson и активно следила за работами 2х профессоров, но не знала, что это в Техасе.

А еще я была уверена, что моя шеф работает в MD Anderson, так как для меня TMC (Техасский медицинский центр) и MD Anderson было одним и тем же. А Оказалось, что TMC это огромная штука, которая включает в себя MD Anderson, Baylor College of Medicine (где работаю я), UTHealth и др.

А еще хотела написать, что многие думают, что на fellowship нужно подавать только, если PI не дает зарплату (или у PI нет денег на вас).
Но fellowship это по большей части для вашего резюме. Будет намного проще подаваться на большие гранты в будущем имея успешный опыт.

Так, что да. Если собираетесь делать постдок, начинайте писать профессорам за 6 месяцев до защиты. Пока пройдете интервью, пока получите документы, уже пройдет около года.

Пишу 2 заявки на fellowship. Часики уже настолько сильно затикали, что это мой последний шанс подать на большинство стипендий для постдоков в США, доступных для не-резидентов.

Ужасно, конечно, что я даже не думала, что заявки на постдок позиции нужно подавать до защиты. Где такому учат?

А с учетом переезда в Финляндию и полугодового ожидания решения по визе в США, я потеряла 2 года после защиты.

Она мечтала работать с NSG-SGM3 мышами.

Я с самого начала своего научного пути читала много статей. Вообще, читая первую в жизни научную статью, я очень испугалась, так как ничего не поняла. Так же было и со второй и с третьей. Только после прочтения еще 20-30 и загугливания каждого слова дело пошло в гору. И как некоторые из вас знают, я уже с 2016 года занимаюсь острым миелоидным лейкозом. Меня всегда интересовали трансляционные исследования, и когда я, будучи аспирантом, читала статьи больших ученых, я видела, что они используют NSG мышей. Потом на горизонте появились гуманизированные NSG-SGM3 мыши, которые больше подходят для трасплантации бластных клеток от пациентов с острым лейкозом. Я работала с клеточными линиями, которых было в целом не так мало. Но хотелось большего, а именно валидировать результаты на клетках пациентов. Доступа к ним у нас не было, как и самой кухни. Чего уж говорить, я не знала, как «фиколить» до 2022 года, да и вакцины от гепатита у меня не было, так что в целом хорошо, что никакие клетки не обученной мне не достались.
В моем мире розовых ученых, я колола клетки пациентов в пушистых мышей и все на свете валидировала. Мышей нужно было бы заказывать из JAX и держать в специальном виварии, а еще было бы неплохо где-то научиться с ними правильно работать и где-то брать деньги на такие вещи. В общем и целом, диссертация моя построена на клеточных линиях и анализе общедоступных баз данных пациентов, а теперь я могу заказать мышь из JAX, она приедет через 4 дня, и я даже знаю, что и куда колоть, как это выделять и анализировать.

Мне кажется, я в целом редко косячу в лаборатории из-за невнимательности, но сегодня я сварила ТРИ ЛИТРА агаризованной среды LB вместо жидкой.

С днем тупости и невыделенных плазмид.

Очень грустно, что я не выиграла стипендию, но очень приятно, что моя PI меня поддерживает и настраивает на победу в следующем году.

Три года назад моим заданием было - написать быстренько статью в Мол.Биол. Сейчас задания схожие, только журнал Cancer Discovery.

Хоть это и не настоящая статья, а Spotlight, я очень рада, что наконец-то моя аффилиация в Scopus сменится, и при подаче на грант будет +1 достижение, о котором можно написать в personal statement.

1 год (без трех дней) в этой лаборатории 🎉

@alisarbg

Doctoral Researcher, developing hydrogen electrode to meet the circular economy principles

🔍Electrocatalysis

📍Finland, Espoo

🧪Aalto University, Electrochemical Energy Conversion and Storage

🔗https://www.aalto.fi/en/open-positions/doctoral-researcher-developing-hydrogen-electrode-to-meet-the-circular-economy-principles?check_logged_in=1

оформлено с помощью @postdocbot

🇫🇮

Каждый второй раз, открывая кэжуал письмо от своего босса, я не могу поверить, что реально работаю с ней.

Не записывайтесь на приборы на 9 утра 😀

Как мне пришлось записывать 30 проб + 8 контролей на цитометре за 15 минут.

Я сейчас тестирую разные методы для культивирования мышиных гемопоэтических предшественников ex vivo.

Во вторник у меня был мышиный эксперимент, в котором нужно было насортировать HSPC из мышей с тремя разными генотипами и подготовить пробы для РНК, ДНК и белка. Также я посеяла часть клеток в планшеты и обработала препаратами.

Измерять токсичность я планировала через 72 часа, то есть в пятницу.

Записаться на цитометр получилось только на 9 утра.

Утром я не проверила расписание и подумала, что начало в 9-30.

Ну это еще пол беды.

Изначально я планировала красить антителами, а потом Annexin V в отдельном буфере.

То есть это как минимум 55 минут включая отмывки.

Пока мешала антитела, поняла, что у меня нет подходящего Annexin, так как используемой мной Alexa 647 перекрывается со Sca1-APC.

Вообщем, я решила избавиться от Annexin и красить только антителами.

Пока добежала до цитометра было уже 10-05, промыла к 10-15 и начала экстренно снимать.

Благо у меня был template эксперимента и вольтажи практически не пришлось подкручивать.

В общем, в моей голове проносилось next tube, глаза боялись, а руки делали.

Сейчас смотрю на результаты, вроде бы эксперимент получился неплохим.

Обожаю очистку ДНК на магнитных частицах! Выглядит очень медитативно.

Сегодня на лекции Prof Jeffrey Rosen, который получает награду за менторство.

Прекрасная инициатива, так как без ментора практически невозможно построить карьеру.

Многие из его трайнис стали профессорами, и он по сей день с ними коллаборирует.

Люблю это чувство, как это его там..
Откалиброванные пипетки!