Bioinformatics Institute

В продолжении дискуссии о Нобелевской премии приглашаем на встречу BIOCAD Guest Club, посвященную достижениям в области химии и машинного обучения | 24 октября, 19:30 МСК

Павел Яковлев (вице-президент по ранней разработке и исследованиям, BIOCAD) и Антон Чугунов (с.н.с. ИБХ РАН, главный редактор «Биомолекулы») обсудят на встрече:

1. За какие открытия была присуждена Нобелевская премия по химии в 2024 году?
2. Почему премия по химии присуждена программистам?
3. Как машинное обучение влияет на биохимию и изменит ли оно методологию научных исследований?
4. Какие существуют перспективы использования этих технологий в фармацевтике и медицине?

Модератор встречи — Анна Владимирова, директор Департамента научного развития BIOCAD.

Прямая трансляция пройдет в VK, присоединяйтесь!

#bioinf_events @bioinformatics_institute

Сегодня в 19:00 состоится открытая лекция Александры Мамчур: «Нельзя так просто взять и применить AlphaFold»
bioinf.me/guests | Регистрация

На встрече вы узнаете, в чем сложность предсказания структуры белка, какие конкретные задачи можно решать с помощью AlphaFold и что невозможно сделать с его помощью на текущий момент.

Регистрация доступна по ссылке, встреча будет проходить на платформе Zoom.

Ждем вас!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Нельзя так просто взять и применить AlphaFold:
bioinf.me/guests | 21 октября, 19:00

На этой открытой лекции Александра Мамчур расскажет о роли AlphaFold в решении задач структурной биологии: ответит на вопросы о том, почему предсказание структуры белка представляет собой сложную вычислительную задачу, какие конкретные проблемы способен решать AlphaFold3, а также обсудит его ограничения и проблемы, с которыми этот алгоритм справиться пока не может.

Приходите на лекцию, это хороший шанс узнать больше про технологию, отмеченную нобелевской премией: bioinforussia.timepad.ru/event/3074250

Спешите быть!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Делимся новостями и статистикой набора годовой программы по биоинформатике:
bioinf.me/education/program

6 сентября состоялась очная встреча студентов с кураторами и преподавателями Института, во время которой они познакомились друг с другом и отметили начало учебного года.
На следующий день 60 студентов программы профессиональной переподготовки по биоинформатике начали обучение. Сейчас, к середине семестра, они уже овладели необходимыми навыками для работы с командной строкой, выполнили свой первый учебный проект по статистике и визуализации данных в R, начали изучать Python, Git и базовые биоинформатические алгоритмы. Все это – подготовка к практикуму по анализу данных NGS, который начнется уже на этой неделе!

Хотим поделиться с вами статистикой зачисления на программу в этом году: лишь 32 из 60 студентов попали на программу с первой попытки, так что не стоит сдаваться, если вам не удалось поступить с первого раза — мы будем рады вашим заявкам на следующий набор и встречам на собеседованиях весной!
А если вам интересно, как лучше подготовиться к поступлению – рекомендуем ознакомиться со страницей годовой программы, а также списком онлайн-курсов Института биоинформатики!
Желаем хорошего дня!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

21 октября в 19:00 cостоится открытая лекция, посвященная AlphaFold:
bioinf.me/guests

Вчера алгоритм предсказания трёхмерных структур биомолекул AlphaFold получил нобелевскую премию. Однако действительно ли он является панацеей в мире структурной биоинформатики?
Александра Мамчур, сотрудник кафедры биофизики МГУ, расскажет, почему предсказание структуры белка представляет собой сложную вычислительную задачу, какие конкретные проблемы способен решать AlphaFold3, а также обсудит ограничения и вопросы, для решения которых эта технология пока остаётся менее эффективной.

Регистрация на лекцию доступна по ссылке: bioinforussia.timepad.ru/event/3074250


Ждем всех!
YouTube: Bioinformatics Institute
#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Обучение на интенсиве по алгоритмической биоинформатике уже началось:
bioinf.me/education/inf

На этом курсе, посвящённом вычислительной биологии, учится 21 студент из 11 городов мира. В минувшую субботу они сделали первые шаги в изучении биоинформатики, прослушав лекции по организации клетки, методам молекулярной биологии и технологиям секвенирования. Впереди их ждут занятия по молекулярным основам наследственности, статистике, биоинформатическим алгоритмам и, наконец, работа над выпускным проектом — созданием пайплайна для решения биомедицинской задачи.

Мы очень рады вновь запустить наши образовательные программы для информатиков, желаем студентам успехов и с нетерпением ждём результатов их выпускных работ!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Bioinformatics Institute pinned «С чего начать погружение в мир биоинформатики? stepik.org/org/bioinf Отвечаем на один из самых популярных вопросов в нашем карьерном чате: у Института биоинформатики более 20 открытых курсов на образовательной платформе Stepik, с которых вы можете начать…»

С чего начать погружение в мир биоинформатики?
stepik.org/org/bioinf

Отвечаем на один из самых популярных вопросов в нашем карьерном чате: у Института биоинформатики более 20 открытых курсов на образовательной платформе Stepik, с которых вы можете начать ваш путь!

Курсы охватывают темы от молекулярной биологии до программирования на Python, например:
❤️ Молекулярная биология и биология клетки — Молекулярные основы функционирования живых клеток, передачи и реализации наследственной информации;
❤️ Биотехнологии: генная инженерия — Базовые методы генной инженерии: получение рекомбинантной ДНК, ПЦР, молекулярное клонирование, синтез генов, белков и геномов;
❤️ Введение в Linux — Знакомство с операционной системой Linux, командной строкой и работой на удаленном сервере;
❤️ Введение в NGS — Основные типы секвенирования, области их применения, контроль качества и первые шаги в обработке данных NGS;
❤️ Молекулярная филогенетика — Основы филогенетического анализа последовательностей нуклеиновых кислот или белков;
❤️ Программирование на Python — Базовые понятия языка Python: Объекты, операторы, функции, библиотеки и др.;
❤️ Основы программирования на R — Первые шаги в программировании на R для анализа данных: операции над векторами и матрицами, библиотека dplyr;
❤️ Управление вычислениями — Linux контейнеры, Docker и инструменты автоматизации вычислений.

Нравится решать сложные алгоритмические проблемы? Попробуйте свои силы на заданиях прошедшего контеста по биоинформатике!

Больше открытых курсов вы найдете по ссылке: stepik.org/org/bioinf
Приятной учебы!

YouTube: Bioinformatics Institute
#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

10 сентября стартовал интенсив по клинической интерпретации данных NGS:
bioinf.me/education/workshops/clin

Студенты уже повторили основы молекулярной биологии, узнали с чего начинается анализ клинического кейса, а также как проходит секвенирование и биоинформатическая обработка данных NGS. Сегодня участники учатся работать с геномным браузером IGV: тренируются определять эффект, генотип и аллельный баланс вариантов, что в дальнейшем пригодится при анализе выпускного клинического кейса!

Для вас мы приготовили задачу по генетике: как вы думаете, какой тип наследования изображен на схеме? 😉

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

На прошлой неделе началась программа переподготовки по биостатистике и анализу медицинских данных:
bioinf.me/education/stat

Студенты уже послушали первые лекции по теории вероятностей, методологии доказательной медицины, программированию на R и визуализации данных. Впереди ещё 5 насыщенных месяцев, а для того, чтобы задать общий вектор обучения, мы поделились нашими «10 заповедями биостатистика», которые могут помочь найти свои внутренние ориентиры в этой непростой профессии!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Регистрация на интенсив по клинической интерпретации данных NGS 2024 завершена: bioinf.me/education/workshops/clin

Из-за ограниченного числа мест мы вынуждены закрыть регистрацию на курс досрочно, но уже этой зимой сообщим о датах следующего запуска!

Не переключайтесь!
#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Напоминаем о регистрации на интенсив по клинической интерпретации данных NGS:
bioinf.me/education/workshops/clin | 10 сентября — 2 ноября

Курс будет полезен врачам-генетикам, начинающим клиническим интерпретаторам и всем, кто интересуется анализом данных секвенирования. На интенсиве вы научитесь находить и классифицировать мутации, ассоциированные с фенотипом пациента: освоите работу с геномными браузерами, биомедицинскими базами данных, а также узнаете, как применять критерии ACMG. Помимо этого, разберетесь в этических аспектах клинической интерпретации и посетите лекции приглашенных специалистов.
Выпускной проект — анализ учебного клинического кейса. По результатам обучения выдается удостоверение о повышении квалификации или сертификат участника.

Чтобы присоединиться необходимо:
- Набрать 59 баллов на вступительном курсе на Stepik (займет около 4 часов)
- Заполнить анкету участника до 31 августа 23:50 МСК. Доступ к анкете откроется после прохождения вступительного курса.

А если вы хотите узнать больше о работе клинического интерпретатора — посмотрите открытую лекцию авторов интенсива:
- Генетический детектив: интерпретация NGS-данных в диагностике наследственных болезней | Катерина Данько и Полина Богайчук

Спешите быть!
#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Вакансии из чата Института биоинформатики:
t.me/bioinf_career

Делимся актуальными предложениями в области биоинформатики! В списке позиции как для PhD и научных сотрудников, так и для разработчиков ПО, биостатистиков и молекулярных генетиков:

⚫️telegra.ph/Podborka-vakansij-chata-Instituta-bioinformatiki-08-22

Больше возможностей можно найти по хештегу #вакансии в чате Института: t.me/bioinf_career 😉

#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Продолжается набор на интенсив по клинической интерпретации данных NGS: bioinf.me/education/workshops/clin

Интенсив пройдет с 10 сентября по 2 ноября и подойдет тем, кто хочет научиться интерпретировать данные экзомного или геномного секвенирования. На курсе вы научитесь:
🟡находить генетические причины моногенных заболеваний;
🟡классифицировать однонуклеотидные замены и CNV по критериям ACMG/AMP и их модификациям;
🟡работать с геномными браузерами, популяционными и медико-биологическими базами данных;
🟡оформлять заключение по результатам анализа.
В ходе обучения вы будете работать над интерпретацией учебных клинических кейсов и сможете применять новые знания на практике!

По итогам обучения выдается сертификат об участии. Для получения удостоверения о повышении квалификации необходимо выполнить 50% домашних заданий и защитить выпускной проект.

Чтобы принять участие в интенсиве — пройдите вступительный онлайн курс и заполните анкету до 31 августа 23:50 МСК.
Ждем вас!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

Последний день приема заявок на программу повышения квалификации «Алгоритмическая биоинформатика 2.0»!
bioinf.me/education/inf | 28 сентября — 14 декабря

На курсе вы познакомитесь с вычислительной биологией и анализом биомедицинских данных и изучите:
- Основы молекулярной биологии;
- Алгоритмы в биоинформатике;
- Введение в статистический анализ данных;
- Работу с геномными утилитами;
- Разработку пайплайнов для анализа данных NGS;
А в конце обучения защитите выпускной проект.

Для участия в программе необходимо заполнить анкету до 4 августа 23:59 МСК, решить вступительный тест 9 или 11 августа и пройти онлайн-собеседование в сентябре.

Присоединяйтесь!
#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Напоминаем про регистрацию на программу повышения квалификации «Алгоритмическая биоинформатика 2.0»!
bioinf.me/education/inf | Дедлайн регистрации: 4 августа 23:59 МСК

Курс предназначен для тех, кто хочет познакомиться с вычислительной биологией и анализом биомедицинских данных, и включает такие темы, как:
- Основы молекулярной биологии;
- Алгоритмы в биоинформатике;
- Введение в статистический анализ данных;
- Работа с геномными утилитами;
- Разработка пайплайнов для анализа данных NGS;
А также дополнительные лекции, посвященные разнообразию биоинформатических задач в науке и индустрии и навыкам, необходимых для работы в этой сфере.
Завершится обучение выполнением выпускного проекта, в ходе работы над которым учащиеся применят полученные знания на практике.

Для участия необходимо заполнить анкету до 4 августа 23:59 МСК, решить вступительный тест 9 или 11 августа и пройти онлайн-собеседование. Подробное описание программы обучения и вступительных мероприятий доступно на сайте: bioinf.me/education/inf

Успейте подать заявку!
#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute

Завершился Летний лекторий 2024 по молекулярной биологии и биоинформатике!
bioinf.me/open_summer | Записи лекций

В этой серии открытых лекций слушатели познакомились с основами молекулярной биологии, разнообразием биомедицинских проблем и вычислительных методов для их решения. Преподаватели лектория рассказали про методы анализа структуры хроматина, поиск причин генетических заболеваний, предметы изучения метагеномики и протеомики, а также про применение биоинформатики при разработке лекарств и в онкологии.
Записи лекций доступны на нашем канале. Также мы открыли доступ к заданиям по темам лекций, с помощью которых вы можете закрепить материал.
Благодарим участников за активность на занятиях и ждем на грядущих мероприятиях Института!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop
@bioinformatics_institute

Завтра последний день регистрации на онлайн-программу переподготовки «Биостатистика и анализ медицинских данных» 2024/25: bioinf.me/education/stat 

Программа ориентирована на людей, планирующих работу в индустрии или научную карьеру, с базовыми навыками статистического анализа на языке R и включает модули:
1. Методология и регуляторика
2. Специфика медицинских данных
3. Статистика и анализ данных
4. Программирование

Успейте подать заявку до 26 июля, 21:00 МСК!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop
@bioinformatics_institute

До 26 июля открыт набор на программу переподготовки «Биостатистика и анализ медицинских данных»: bioinf.me/education/stat

Участники пройдут путь от изучения классических методов статистического анализа до современных методов машинного обучения, научатся программировать и визуализировать данные с помощью R, познакомятся с основами методологии и регуляторики клинических исследований, будут работать над научными проектами и поучаствуют в хакатоне по индустриальной биостатистике!

Чтобы принять участие в программе вам нужно:
– подать заявку до 26 июля, 21:00 МСК
– пройти вступительное тестирование 27 июля или 3 августа

Конец августа и начало сентября посвящены самостоятельной работе, с 11 сентября и до конца декабря занятия будут проходить по вечерам сред и субботам в Zoom, в январе участники завершают работу над научными проектами.

Подробнее о программе и о том, как проходит обучение мы рассказывали на дне открытых дверей и в статье на Биомолекуле.

Успейте подать заявку!

#bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop
@bioinformatics_institute

Приглашаем на новую программу повышения квалификации Института «Алгоритмическая биоинформатика 2.0»!
bioinf.me/education/inf | Дедлайн регистрации: 4 августа

Мы рады объявить набор на программу, посвященную алгоритмической биоинформатике, которая пройдет онлайн с 28 сентября по 14 декабря!
Этот курс предназначен для людей с техническим образованием, которые хотят познакомиться с вычислительной биологией и анализом данных на практике. Обучение включает в себя основы молекулярной биологии, статистики, а также реализация алгоритмов и создание пайплайнов для анализа данных NGS. На дополнительных лекциях преподаватели познакомят с разнообразием задач, которые решает биоинформатика, и расскажут о навыках, необходимых для работы в этой сфере. По окончании основной части обучения студенты закрепят полученные знания выполнением выпускного проекта.

Для участия в программе необходимо заполнить анкету до 4 августа 23:59МСК, решить вступительный тест 9 или 11 августа и пройти онлайн-собеседование. Стоимость курса составляет 29 000 рублей. Студенты очной формы обучения могут претендовать на грант, а выпускникам программ переподготовки и повышения квалификации Института биоинформатики предоставляется скидка 10%.

Ждем ваших заявок!
#bioinf_education #bioinf_online @bioinformatics_institute