RSG - Iran

🟢انتخابات یکی از ارکان اساسی در هر ارگان سازمان یافته است.
انتخابات نه تنها ابزاری برای برگزیدن رهبران است، بلکه بخشی از یک مشارکت اجتماعی و فرهنگی است که به توسعه یک ارگان و نیز جامعه سالم و متعادل کمک می‌کند.

🔜 ما نیز در RSG-Iran، در راستای حرکت در یک مسیر نظام مند و بر اساس قانون انجمن جهانی ISCB برای شاخه‌های دانشجویی، پروسه برگزاری انتخابات را در دستور کار قرار دادیم.
در این راستا از تمام اعضای انجمن که در سایت RSG-Iran عضو هستند جهت کاندید شدن در دو پست مدیریت و دبیری انجمن دعوت به عمل می آید.

🔴 لازم به ذکر است که این انتخابات در سایت RSG-Iran برگزار خواهد شد.

🗓 زمانبندی انتخابات پیش رو به شرح زیر است:

➖ زمان پایان پذیرش عضویت جدید در سایت rsg ایران: 20 نوامبر (۳۰ آبان)
➖ بازه اعلام کاندیداتوری: 20 تا 23 نوامبر (۳۰ آبان تا ۳ آذر)
➖ تایید کاندیداها توسط کمیته: به صورت همزمان با اعلام کاندیداتوری تا 24 نوامبر (۴ آذر)
➖بازه تبلیغات: 24 تا 29 نوامبر (۴ تا ۱۰ آذر)
➖زمان برگزاری انتخابات در سایت : 1 دسامبر (۱۱ آذر)
➖ اعلام نتایج: 2 دسامبر (۱۲ آذر)

🔈 روایتی از یک شگفتی
برنده‌‌ی نوبل ۲۰۲۴ شیمی
AlphaFold!

🖥 آلفافولد یک برنامه هوش مصنوعی است که توسط شرکت Google DeepMind توسعه پیدا کرده است تا ساختار پروتئین‌ها را پیش‌بینی کند.

💻 این برنامه به عنوان یک سیستم یادگیری عمیق طراحی شده است. آلفافولد راه‌حل مسئله‌ای است که بیش از ۵۰ سال دانشمندان را به‌ چالش کشیده بود؛
پروتئین‌ها به چه شکلی تا می‌خورند؟

📌گردآوردنده: آی‌س‍ـــان نــقــابـــــی

🚀 Telegram
🖼 LinkedIn
🖼 Instagram

😂 وقتی فکر می‌کنی، علوم پایه پزشکی و گروه زیست بخونی دیگه از دست ریاضی و فیزیک نفس راحت می‌کشی.
😂😔😐😂

🚀 Telegram
🖼 LinkedIn
🖼 Instagram

✨ بیست و هفتمین #ژورنال_کلاب شاخه دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران

📌موضوع:
Sampling the conformtional staes of p2X receptors with Alpha Fold 3

👨🏻‍💻با حضور جناب آقای امیرحسین سلطانی

🗣️ آقای امیرحسین سلطانی، ارشد بیوانفورماتیک از University of Leicester را دارند.

✏️ پیش از این، مدرک کارشناسی خود را در رشته‌ی سلولی و مولکولی از موسسه آموزش عالی کاویان، دریافت کرده‌‌اند.

🧬 در حال حاضر ایشان با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی، الگوریتم‌ها و زبان‌های برنامه‌نویسی مانند پایتون و R در تجزیه و تحليل مجموعه داده‌های بیولوژیکی در مقیاس بزرگ مشغول به فعالیت هستند.

💎 یکی از دستاوردهای قابل توجه ایشان مدیریت پروژه‌ای در مورد اثرات ترمیم زخم نانوکامپوزیت ZnO حاوی عصاره آلکمیلا در موش است که در یک مجله علمی منتشر شد.

🖥 جهت آشنایی بیشتر با پروژه‌های تحقیقاتی جناب آقای امیرحسین سلطانی می‌توانید به اکانت لینکدین ایشان مراجعه کنید.

✔️آلفا فولد AlphaFold) 3) جدیدترین نسخه از مدل هوش مصنوعی است که  Google DeepMind آن را توسعه داده است.  این مدل با تکیه بر موفقیت‌های مد‌ل‌های پیشین خود نه تنها با پیش‌بینی ساختارهای سه‌بعدی پروتئین‌ها بلکه با ترسیم نحوه تعامل این پروتئین‌ها با سایر مولکول‌های زیستی مانند DNA، RNA، یون‌ها و مولکول‌های کوچک، به فعالیت خود ادامه می‌دهد.


✔️این قابلیت برای درک فرآیندهای بیولوژیکی پیچیده و تسریع در طراحی دارو ضروری است. یکی از پیشرفت‌های قابل توجه در آلفا فولد ۳ توانایی آن در پیش‌بینی برهمکنش بین پروتئین‌ها و طیف گسترده‌ای از مولکول های دیگر است که می‌تواند به طراحی داروهای جدید و درک بیماری‌ها در سطح مولکولی کمک کند.

🔈 نمونه‌برداری از حالت‌های مختلف ساختاری گیرنده‌های P2X با استفاده از AlphaFold 3 می‌تواند درک ما از این پروتئین‌های منحصربه‌فرد را که نقش مهمی در فرآیندهای فیزیولوژیکی مختلف بازی می‌کنند، متحول کند. گیرنده‌های P2X خانواده‌ای از کانال‌های یونی متصل به لیگاند هستند که توسط ATP فعال می‌شوند و در عملکردهای بیولوژیکی متعددی از جمله:
🟢 احساس درد
🟢التهاب
🟢و انتقال عصبی نقش دارند. درک حالات مختلف ساختاری آنها مانند:
📱بسته
📱باز
📱حساسیت زدایی، هم برای بیولوژی پایه و هم برای مداخلات درمانی ضروری است.


🗓 زمان برگزاری: یکشنبه ۲۰ آبان ماه
🔜 ساعت برگزاری: ۲۰ الی ۲۲
🌐 ثبت‌نام در سایت رایازی



🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

RSG Iran is a Regional Student Group under the student council of the International Society for Computational Biology. This makes it a student association.

🌐Consequently, the annual election of a new organizational committee is a mandated rule. This election includes the roles of president and secretary.

🔈With the current committee's term ending, RSG Iran is scheduled to hold an election on December 1st, 2024, to appoint the new organizational committee for the upcoming year. Candidate registration and voting are exclusive to RSG Iran members.

🔖Membership requires an account on www.rsgiran.com. Once membership is validated, all members are eligible to register as candidates and also vote.

👍To ensure the integrity of the election, new memberships will be suspended from November 20th.

🚨 Accordingly, to participate, please ensure your membership is registered on the website prior to the December 20th.

🚀 Telegram
🖼 LinkedIn
🖼 Instagram

انجمن RSG Iran شاخه‌ی دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی (ISCB) و لذا یک انجمن دانشجویی محسوب می‌گردد.

🌐 برگزاری انتخابات سالانه برای تعیین تیم مدیریت جدید از قوانین این انجمن محسوب می‌شود. تیم مدیریت شامل مدیر و دبیر انجمن است، و انتخاب معاونین پس از انتخابات و توسط مدیر انجمن صورت می‌گیرد.

🔈 با توجه به پایان دوره فعالیت مدیر و دبیر فعلی انجمن RSG Iran در تاریخ ۱ ژانویه ۲۰۲۵ (۱۲ دی‌ماه ۱۴۰۳)، این انجمن ملزم به برگزاری انتخابات در جهت انتخاب مدیر و دبیر جدید، برای مدیریت این انجمن به مدت یک‌سال می‌باشد.

🔖 به اطلاع می‌رساند، تنها افرادی که عضو RSG Iran هستند، می‌توانند به عنوان کاندیدای تنها یکی از این دو مسئولیت ثبت‌نام نمایند‌.

🔍 همچنین شرکت در انتخابات و دادن رای، تنها برای اعضای این انجمن ممکن می‌باشد.

🖥 عضویت در این انجمن مستلزم داشتن یک حساب کاربری در  وبسایت www.rsgiran.com است و تمامی اعضا پس از تایید عضویت‌شان، می‌توانند به عنوان کاندیدا ثبت‌نام نمایند و همچنین در روز انتخابات، رای خود را ثبت نمایند.

👍 بنابراین، در صورت تمایل به شرکت در این انتخابات، لازم‌است با ساخت حساب کاربری در سایت ما، عضویت خود در این انجمن را ثبت نمایید.

🚨 همچنین به اطلاع می‌رساند، انتخابات انجمن RSG Iran در دهه اول دسامبر برگزار خواهد شد و به جهت افزایش سلامت انتخابات، ده روز قبل از برگزاری انتخابات، یعنی از ۲۰م ماه نوامبر میلادی همزمان با ۳۰ آبان ماه ۱۴۰۳ شمسی، امکان عضویت جدید در وبسایت انجمن، مقدور نخواهد بود.

🚀 Telegram
🖼 LinkedIn
🖼 Instagram

💻 🔠🔤 🔠🟢🔠🔠

✔️ مسابقه برنامه‌نویسی هفتگی CB code پنجشنبه ۱۰ آبان ماه آغاز می‌شود!

💻 در این سلسله مسابقه‌ها، در کنار یکدیگر کدنویسی می‌کنیم. در هر دور، با تعدادی چالش‌ مواجه خواهیم شد که برای حل کردن آن‌ها از کدنویسی استفاده خواهیم کرد.

🔼امتیازدهی بر اساس:
🟢 درستی پاسخ‌ها
✔️ و زمان حل سوالات انجام می‌شود.

📈 هر چه سریع‌تر و دقیق‌تر پاسخ دهید، امتیاز بیشتری کسب خواهید کرد!

🎁 برای نفرات برتر جوایزی در نظر گرفته‌ایم و پس از پایان مسابقه، طبق جدول امتیازها به رتبه‌های برتر جوایزی اهدا خواهد شد.

❔سوال‌های مسابقه از مباحث پایه‌ای:
🧬زیست‌شناسی
💻و برنامه‌نویسی شروع می‌شود.

🔼 به تدریج و گام به گام سوال‌ها و چالش‌های مسابقه پیشرفته‌تر شده و به مباحث پیچیده‌تر می‌رسد پس با هر سطح از آمادگی می‌توانید مسابقه را آغاز کنید.

🦾 در دورهای آتی مسابقه‌ CB Code، شما با مسائل روز دنیا در زمینه‌ی: زیست‌شناسی محاسبتی رو به رو خواهید شد که ترکیب سیستم‌های خبره، هوش مصنوعی و داده‌کاوی است.

🤖 داوری:
داوری کاملاً ماشینی، خودکار و آنی است، بنابراین نتایج بلافاصله پس از اتمام مسابقه اعلام می‌شود.

✔️ مراحل اولیه این مسابقه ساده‌تر و مبتنی بر اصول اولیه خواهند بود و به تدریج به مباحث تخصصی‌تر و پیشرفته‌تر خواهیم رسید.

🔥 منتظر شما هستیم! همراه ما در مسابقه CB Code مهارت‌های خود را برای حل مسئله از طریق کدنویسی به چالش بکشید!

📎 با در میان گذاشتن نظرات، پیشنهادات و انتقادات خود در مورد سلسله مسابقه‌های CB Code در برگزاری هرچه بهتر و کامل‌تر این مسابقه‌ها کمک کنید.
🚀@RSG_Iran

➕ CB Code channel
➕ CB Code Community
➕ RSG

🥳 معرفی چند پلتفرم رایگان برای حل سوالات برنامه‌نویسی و تمرین مهارت‌های کدنویسی:

🇮🇷 در داخل ایران:

1⃣ آنلیم
✨ یک پلتفورم نوآورانه و بسیار user-friendly، با پشتیبانی از عموم زبان‌های رایج برنامه‌نویسی و دارای بانک سوالات، برگزاری مسابقات و دوره‌های مختلف

2️⃣ کوئرا
🪩 جامعه توسعه‌دهندگان ایران، دارای بانکی غنی از سوالات متنوع در دسته‌بندی‌های گوناگون و برگزاری مسابقات مختلف استخدامی از طرف شرکت‌های ایرانی‌


🌐 بین‌المللی:


1️⃣ HackerRank
🆕 پلتفرمی برای تمرین سوالات برنامه‌نویسی و الگوریتم، با دسته‌بندی بر اساس موضوعات مختلف از جمله علوم داده، هوش مصنوعی، و SQL.


2️⃣ CodeChef
🔗 پلتفرمی برای حل سوالات الگوریتم و شرکت در مسابقات برنامه‌نویسی؛ به‌ویژه مناسب برای مسابقات آنلاین و رقابتی.


3️⃣ LeetCode
🎤 تمرکز بر سوالات مصاحبه‌های کاری در شرکت‌های بزرگ؛ دارای سوالات الگوریتمی و داده‌ساختار برای آماده‌سازی مصاحبه.


4️⃣ Exercism
💻 تمرین زبان‌های برنامه‌نویسی مختلف با راهنمایی از منتورهای حرفه‌ای؛ تمرکز بر یادگیری زبان‌ها و ارتقای مهارت.


5️⃣ Codewars
📱 ارائه چالش‌های برنامه‌نویسی در سطح‌های مختلف؛ امکان انتخاب زبان‌های مختلف برای تمرین و بهبود مهارت.


6️⃣ TopCoder
💻 یکی از قدیمی‌ترین پلتفرم‌ها برای تمرین سوالات برنامه‌نویسی و شرکت در مسابقات کدنویسی رقابتی؛ به‌ویژه مناسب برای شرکت در رقابت‌های بزرگ.


7️⃣ Sphere Online Judge (SPOJ)
🖥 مجموعه بزرگی از سوالات برنامه‌نویسی و الگوریتم برای تمرین و ارزیابی مهارت‌ها.


8️⃣ Coderbyte
💻شامل سوالات الگوریتم و چالش‌های مصاحبه‌های کاری به‌ویژه برای آمادگی در مصاحبه‌های فنی.


9️⃣ Project Euler
📊 تمرکز بر سوالات ریاضی و الگوریتمی که نیاز به برنامه‌نویسی دارند؛ به‌ویژه برای علاقه‌مندان به مسائل پیچیده.


1️⃣0️⃣Edabit

🎮 پلتفرمی برای تمرین مسائل ساده تا پیچیده در زبان‌های مختلف، مناسب برای مبتدیان و توسعه مهارت‌ها.



✔️این پلتفرم‌ها منابع عالی برای تمرین تفکر الگوریتمی و آماده‌سازی برای مصاحبه‌های شغلی و بهبود مهارت‌های برنامه‌نویسی هستند.

🚀 Telegram
🖼 LinkedIn
📱 Instagram

⭐️ بیست و ششمین #ژورنال_کلاب شاخه دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران

📌موضوع:
Genomic characterization and phylogenetic evolution of the canine parvoviruss in Iranian dogs, a nationwide study


👨🏻‍💻با حضور جناب آقای بهنام مصطفوی

🗣️ آقای بهنام مصطفوی، دانشجوی مقطع دکتری زیست‌شناس در دانشگاه Calgary در کاناداست.

✏️ پیش از این، مدرک کارشناسی خود را در رشته‌ی مهندسی پزشکی از دانشگاه صنعتی سهند و مدرک کارشناسی ارشد خود را در رشته‌ی بیوانفورماتیک از دانشگاه صنعتی امیرکبیر،دریافت کرده است.

🧬 هم‌اکنون ایشان در زمینه‌های بیوانفورماتیک و یادگیری عمیق و همچنین توسعه‌دهنده چارچوب‌های مبتنی بر Al برای کاربردهای ژنومیکس، پروتئومیکس و تکامل فعال هستند.

🖥 جهت آشنایی بیشتر با پروژه‌های تحقیقاتی جناب آقای مصطفوی می‌توانید به اکانت لینکدین و گوگل اسکالر ایشان مراجعه کنید.

🧬 مطالعه پاروویروس سگ (CPV) در میان سگ‌های ایرانی بر درک ساختار ژنتیکی ویروس و چگونگی تکامل آن در طول زمان در جمعیت سگ‌های محلی متمرکز و تاثیرگذار است. 

👀 پاروویروس سگ، یک بیماری بسیار مسری و اغلب کشنده در سگ‌هاست. جهش‌های ژنتیکی در این ویروس منجر به سویه‌های ویروسی متنوعی می‌شود که هر کدام به میزانی در حدّت و میزان انتقال متفاوت هستند. 


✔️هدف محققان با انجام توالی‌یابی ژنومی و مشخص کردن سویه‌های CPV موجود در مناطق مختلف ایران، نقشه‌برداری از تغییرات ژنتیکی و شناسایی جهش‌های خاصی است که سویه‌های ایرانی را از آن‌هایی که در سطح جهانی یافت می‌شوند، متمایز می‌کند. این داده‌ها برای:
➕ ردیابی الگوهای سازگاری ویروس
➕ درک گسترش آن
➕ شناسایی نقاط مستعد عفونت CPV در کشور ایران حیاتیست.


🗓 زمان برگزاری: یکشنبه ۱۳ آبان ماه
🔜 ساعت برگزاری: ۲۰ الی ۲۲
🌐 ثبت‌نام در سایت رایازی



🚀 Telegram
🖼 LinkedIn
🖼 Instagram

🔠🔤 🔠🟢🔠🔠

🔣منتظر حضورتان در اولین دوره از مسابقات CB Code هستیم!🔣

🌐 ثبت‌نام در سایت رایازی

🖥 پلتفرم آنلیم

🔗 روم مسابقه در پلتفرم آنلیم

🔒 پسورد روم مسابقه:
➡️ CB-CODE-GATTACA

🟢 Powered by Unlim.ir

✉️ جهت اطلاع از اخبار، به‌روزرسانی‌ها و ارتباط با تیم برگزاری، حتماً در گروه و کانال تلگرامی زیر عضو شوید:
➕ CB Code Channel
➕ CB Code Community
➕ RSG

💻 🔠🔤 🔠🟢🔠🔠

برای شرکت در اولین دوره از سری مسابقات CB Code، از لینک‌های درج شده استفاده کنید:

🌐 ثبت‌نام در سایت رایازی

🖥 پلتفرم آنلیم

🔗 روم مسابقه در پلتفرم آنلیم

🔒 پسورد روم مسابقه:
➡️ CB-CODE-GATTACA


🎮 پس از تکمیل ثبت‌نام و پروفایل خود در سایت رایازی و پلتفرم آنلیم، می توانید مسابقه CB Code را در داشبورد خود در سایت آنلیم، در قسمت: "مسابقات" > "مسابقات من" مشاهده کنید.

🗓 مسابقه روز پنجشنبه، ۱۰ آبان ماه (۳۱ اکتبر)، رأس ساعت ۱۲ باز خواهد شد و تا ساعت ۱:۳۰ بعدازظهر ادامه خواهد داشت.

🟢 Powered by Unlim.ir


✉️ جهت اطلاع از اخبار، به‌روزرسانی‌ها و ارتباط با تیم برگزاری، حتماً در گروه و کانال تلگرامی زیر عضو شوید:
➕CB Code Channel
➕CB Code Community
➕RSG

📣 بیست و پنجمین #ژورنال_کلاب شاخه دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران

📌موضوع:
Enhancing Genomic language Models for improved Downstream Analysis of DNA Sequencing

👨🏻‍💻با حضور جناب آقای محمد صالح رفاهی

🗣️ آقای محمد صالح رفاهی، دانشجوی مقطع دکتری مهندسی کامپیوتر در دانشگاه Drexel در آمریکا است.

پیش از این، مدرک کارشناسی خود را در رشته‌ی مهندسی برق از دانشگاه امیرکبیر و مدرک کارشناسی ارشد خود را در رشته‌ی یادگیری ماشین از دانشگاه Drexel با تحقیق در زمینه محاسبات زیستی دریافت کرده است.

🧬 هم‌اکنون ایشان در زمینه بررسی و درک داده‌های متاژنومیک از میکروبیوم‌ها با استفاده از روش‌های کلان‌داده‌ها و یادگیری ماشین فعالیت می‌کنند.🗣️

🖥 جهت آشنایی بیشتر با پروژه‌های تحقیقاتی جناب آقای صالحی می‌توانید به اکانت لینکدین و گوگل اسکالر ایشان مراجعه کنید.


🛍 تقویت مدل‌های زبان ژنومی (gLMs) شامل اصلاح مدل‌های زبان بزرگ آموزش‌دیده بر روی توالی‌های DNA برای بهبود عملکرد آن‌ها در وظایف تحلیل پایین‌دستی است.

🧬 هدف این مدل‌ها درک و پیش‌بینی عناصر عملکردی درون ژنوم است، مشابه این که مدل‌های پردازش زبان طبیعی چگونه زبان انسان را تفسیر می‌کنند.

⌨ با استفاده از تکنیک‌های پیشرفته یادگیری ماشین، gLMها می‌توانند الگوها و تعاملات درون توالی‌های DNA را شناسایی کنند و به کارهایی مانند:
📱پیش‌بینی محدودیت عملکردی
📱طراحی توالی
📱 و پیش‌بینی اثرات متغیر کمک کنند.

🌀 این پیشرفت‌ها برای گسترش و عمیق‌شدن درک ما از سیستم‌های پیچیده بیولوژیکی و بهبود دقت تجزیه و تحلیل ژنومی ضروری است.

🗓 زمان برگزاری: یکشنبه ۶ آبان ماه
🔜 ساعت برگزاری: ۲۰ الی ۲۲
🌐 ثبت‌نام در سایت رایازی


🚀 Telegram
🖼 LinkedIn
🖼 Instagram

⚡️کارگاه Single Cell RNA-seq به‌صورت‌ حضوری و مجازی در روزهای ۳۰ام مهر ماه و ۱ آبان ۱۴۰۳ در باشگاه علم و فناوری دانشگاه تهران با تدریس جناب آقای ادیب میرکی برگزار شد.

🗓 شنبه ۵ آبان ماه، آخرین جلسه تدریس این کارگاه با تدریس آقای آرین امانی به صورت آنلاین برگزار می‌شود.

▶️ در این ویدئو کوتاه به اهمیت موضوع Single Cell RNA-seq و نحوه تعامل با شرکت‌کنندگان با زمینه زیست، کامپیوتر و سرفصل‌هایی که در کارگاه تدریس می‌شود از زبان مدرسین کارگاه می‌پردازیم.

🚀 Telegram
🖼 LinkedIn
🖼 Instagram

اولین سری مسابقات 🔠🔠🟢🔠 🔤🔠
Computational biology code

🔣 برای نشان دادن مهارت‌هایتان در یک مسابقه‌ی هیجان انگیز آماده شوید🔣.

🌐 Powered by Unlim.ir

🚀 Telegram
🖼 LinkedIn
📱 Instagram

🔔روز دوم کارگـــاه single cell RNA sequencing

📍پارک علم و فناوری دانشگاه تهران 🔡

🚀 Telegram
🖼 LinkedIn
🖼 Instagram

🔔شاخه‌ی دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران با همکاری آنلیم بزودی سلسله مسابقاتی را تحت‌عنوان CB Code (Computational Biology Code) برگزار خواهد کرد!

🎉 سری رویدادهای رقابتی CB Code، یک تجربه منحصربه‌فرد از ترکیب کدنویسی و زیست‌شناسی‌ست! 🎉

🌍 می‌خواهیم در قالب مسابقات کوچک برنامه‌نویسی، هم کدنویسی کنیم و هم به‌صورت گام‌به‌گام با مباحث زیست‌شناسی محاسباتی آشنا شویم.
گفتنی‌ست که در هر دور، به نفرات برتر جایزه اهدا خواهیم کرد! 🎁

👍 این رویداد برای تمامی علاقه‌مندان به دو زمینه‌ی دانشِ Computational Biology، یعنی دانش محاسبات و زیست‌شناسی طراحی شده است!

👨‍💻 اگر برنامه‌نویس هستید و یا پیش‌زمینه‌ی محاسباتی دارید، این رویداد فرصتی عالی برای آشنایی با سناریوهای واقعی بیوانفورماتیک است. CB Code به شما نشان می‌دهد که در این زمینه‌ی علمی چه مباحثی وجود دارد و چقدر این حوزه به دانش و مهارت برنامه‌نویسان نیازمند است.

👩‍🔬👨‍🔬 اگر زیست‌شناس و یا دارای پیش‌زمینه‌ی علوم تجربی هستید و قصد ورود به دنیای بیوانفورماتیک را دارید، اولین گام یادگیری تفکر الگوریتمی و یک زبان برنامه‌نویسی‌ست. برای شما CB Code فرصتی برای شروع به تمرین کد زدن در مسائل مختلف زیست‌شناسی محاسباتی خواهد بود.

🎒🗿 اگر دانش‌آموزی کنجکاو و علاقه‌مند به برنامه‌نویسی هستید و شاخه های علوم تجربی همواره برایتان جالب توجه بوده، این رویداد نه تنها برای دیدن و درک پیوند میان زیست‌شناسی و کدنویسی فرصتی عالی‌ست، بلکه برای انتخاب رشته‌ی تحصیلی و یا مسیر شغلی در آینده به شما چشم‌انداز بهتری برای تصمیم‌گیری خواهد داد.

👩‍🎓 و اما! اگر خودتان را یک بایوانفورماتیک‌کار حرفه‌ای می‌دانید ، این مسابقات فرصتی برای محک زدن مهارت‌ها و دانش خودتان به موازات نوشیدن یک فنجان چای خواهد بود.

🔜با حل چالش‌های علمی در زمان محدود، می‌توانید توانایی‌های خودتان را در کنار لذت بردن از رقابت با دیگران بسنجید و حتی جایزه دریافت کنید!

🎁 جوایز برندگان:

🥇 مقام اول: جایزه نقدی ۱۰ میلیون ریال
گواهی مدال طلا از طرف ISCB-RSG ایران
کد تخفیف ۱۰۰٪ برای سمینار زیست‌شناسی محاسباتی پیشرفته - HBC 2025
دعوت برای پیوستن به ISCB-RSG و گروه تحقیقاتی رایازی، با فرصت‌های پژوهشی در کنار برترین دانشمندان زیست‌شناسی محاسباتی.

🥈 مقام دوم: جایزه نقدی ۶ میلیون ریال
گواهی مدال نقره از طرف ISCB-RSG ایران
کد تخفیف ۱۰۰٪ برای HBC 2025
دعوت به همکاری پژوهشی با ISCB-RSG و گروه تحقیقاتی رایازی.

🥉 مقام سوم: جایزه نقدی ۴ میلیون ریال
گواهی مدال برنز از طرف ISCB-RSG ایران
کد تخفیف ۱۰۰٪ برای HBC 2025
دعوت به فرصت‌های پژوهشی با ISCB-RSG و گروه تحقیقاتی رایازی.

🏅 مقام‌های چهارم تا دهم: کد تخفیف ۵۰٪ برای HBC 2025.

🩸 جایزه ویژه "First Blood": اولین شخصی که هر سوال را به‌درستی پاسخ دهد، بدون توجه به رتبه نهایی‌اش، کد تخفیف ۱۰۰٪ برای سمینار HBC 2025 دریافت خواهد کرد!

📣 گوش به زنگ باشید و برای نشان دادن مهارت‌هایتان در یک مسابقه‌ی هیجان انگیز خودتات را آماده کنید!

🌐 Powered by Unlim.ir

🚀 Telegram
🖼 LinkedIn
🖼 Instagram

❤️ کارگاه Single Cell RNA Sequencing با تدریس جناب آقای ادیب میرکی شروع شد.🥳

🗓 ۲۹ مهر ماه ۱۴۰۳، جلسه اول

📱 Telegram
📱 LinkedIn
📱 Instagram

📣تنها دو روز تا شروع کارگاه Single Cell RNA Sequencing

برای ثبت‌نام و شرکت در کارگاه به‌صورت آنلاین کمتر از ۴۸ ساعت 🚨 فرصت دارید!

📱 Telegram
📱 LinkedIn
📱 Instagram

💡 فناوری جدید برای تجزیه و تحلیل بیان ژن در سطح  تک سلول‌ها

😮 توالی یابی RNA تک سلولی (scRNA-seq) یک فناوری پیشرفته است که برای تجزیه و تحلیل بیان ژن در سطح تک سلول‌ها استفاده می‌شود که اطلاعات ارزشمندی را در مورد ناهمگنی و عملکرد سلولی ارائه می‌دهد. 

🔖 زمینه‌های توالی‌یابی RNA تک سلولی (scRNA-seq):

➕ زیست شناسی توسعه: scRNA-seq به ردیابی چگونگی تمایز سلول‌ها در طول زمان کمک می‌کند و اطلاعاتی را در مورد مسیرهای رشد بافت‌ها و اندام‌های مختلف ارائه می‌دهد.

➕ تحقیقات سرطان: برای مطالعه ناهمگنی تومور، شناسایی زیرجمعیت‌های متمایز سلول‌های سرطانی که ممکن است به مقاومت دارویی، متاستاز یا پیشرفت بیماری کمک کنند، استفاده می‌شود.

➕ ایمونولوژی: scRNA-seq به محققان اجازه می‌دهد تا تنوع سلولی ایمنی را مطالعه کنند و جمعیت سلول‌های ایمنی نادر و همچنین نحوه واکنش این سلول‌ها به عفونت، التهاب یا سرطان را کشف کنند.

➕ علوم اعصاب: مطالعه انواع سلول‌های مختلف سیستم عصبی در، نقشه برداری از چگونگی کمک سلول‌های مختلف به رشد مغز، عملکرد  و بیماری‌های عصبی مانند آلزایمر کمک کننده است.

➕ تحقیقات سلول‌های بنیادی: محققان از scRNA-seq برای مطالعه رفتار و مسیرهای تمایز سلول‌های بنیادی استفاده می‌کنند که به پیشرفت در پزشکی بازساختی کمک می‌کند.

➕ تحقیقات بیماری‌های عفونی: به فهم فعل و انفعالات پاتوژن میزبان در سطح تک سلولی کمک می‌کند و نحوه واکنش انواع سلول‌های مختلف به عفونت‌هایی مانند COVID-19 را شناسایی می‌کند.

➕ تحقیقات قلبی عروقی: scRNA-seq برای مطالعه بافت قلب استفاده می‌شود و به ترسیم انواع سلول‌های دخیل در بیماری قلبی و مکانیسم‌های ترمیم پس از آسیب‌های قلبی کمک می‌کند.

🔝 اهمیت توالی یابی RNA تک سلولی:

📎 ناهمگنی سلولی: scRNA-seq تفاوت‌های بیان ژن را بین سلول‌های فردی آشکار می‌کند که می‌تواند برای فهم بافت‌ها یا بیماری‌های پیچیده بسیار مهم باشد.

📎 شناسایی سلولی نادر: این روش می‌تواند انواع سلول‌های نادر یا قبلا ناشناخته را شناسایی کند که می‌تواند برای درک مکانیسم یا توسعه بیماری بسیار مهم باشد.

📎 الگوهای بیان ژن: امکان نقشه‌برداری دقیق از بیان ژن در انواع مختلف سلول، بهبود درک فرآیندهای بیولوژیکی و مسیرهای سیگنالینگ را فراهم می‌کند.

📎 کشف مکانیسم بیماری: با تجزیه و تحلیل سلول‌های بیمار در مقابل سلول‌های سالم، scRNA-seq به کشف چگونگی توسعه بیماری‌ها در سطح سلولی کمک می‌کند و به توسعه درمان.های هدفمند کمک می‌کند.

✏️زمینه‌های پژوهشی که در آن scRNA-seq استفاده می‌شود:

🧬ژنومیک سرطان و ایمونوتراپی: درک ریزمحیط تومور و رفتار سلول‌های ایمنی.

🧠 اختلالات عصبی: بررسی تغییرات بیان ژن در بیماری‌هایی مانند: آلزایمر، پارکینسون و اسکیزوفرنی.

🦠 بیماری‌های عفونی: بررسی پاسخ‌های ایمنی و آسیب بافتی ناشی از عفونت‌ها.

🩺 سلول‌های بنیادی و پزشکی احیا کننده: بررسی تمایز سلولی و بازسازی بافت.

🫀 قلب و عروق: نقشه برداری از انواع سلول‌های قلب برای بهبود درمان‌های جدید برای بیماری‌های قلبی.

❗️تاثیر scRNA-seq در یک مقاله:
اگر مقاله‌ای حاوی scRNA-seq باشد، به‌طورمعمول به دلیل:
⬆️فناوری پیشرفته،
⬇️تجزیه و تحلیل دقیق
⬆️و حجم بالای داده‌های تولید شده، نشان از یک مطالعه سطح بالاست.

💯این مطالعات اغلب اطلاعاتی در مورد فرآیندهای بیولوژیکی پیچیده ارائه می‌دهند که منجر به انتشار در مجلات با ضریب تاثیر بالا می‌شود.

✅مطالعاتی که از این تکنیک استفاده می‌کنند در زمینه‌هایی مانند: پزشکی دقیق و شخصی‌سازی شده و مدل‌سازی بیماری کمک کننده هستند.

🔗 برای کسب اطلاعات کامل و طبقه‌بندی شده در مورد single cell RNA sequencing می‌توانید در سومین کارگاه شاخه دانشجویی انجمن جهانی زیست محاسباتی شرکت کنید؛ به‌دلیل استقبال شما همراهان و مخاطبان عزیر ظرفیت حضوری کارگاه تکمیل شده است و می‌توانید از فرصت محدودی که باقی مانده است برای شرکت در کارگاه به‌صورت آنلاین استفاده کنید.

📱 Telegram

📱 LinkedIn

📱 Instagram

‼️ برای بیش از ۱۵۰ سال، نشریه Nature سنگ بنای اکتشافات و نوآوری‌های علمی بوده است.  از تحقیقات پیشگامانه گرفته تا بررسی های روشنگرانه.

🖥 نشریه Nature طیف گسترده‌ای از رشته‌ها را پوشش می‌دهند و آخرین پیشرفت‌ها را به‌طور مستقیم در دسترس شما قرار می‌دهند.  

❓آیا می‌دانستید که nature اولین مقاله در مورد ساختار DNA توسط واتسون و کریک را در سال ۱۹۵۳ منتشر کرد؟ 

🔍 چه در حال جست‌وجو در اسرار کیهان یا جست‌وجو در پیچیدگی‌های زندگی روی زمین باشید، نشریات Nature بستری را برای باهوش‌ترین ذهن‌ها فراهم می‌کنند تا یافته‌های خود را به اشتراک بگذارند.

برای مطالعه بیشتر درمورد نشریه نیچر پست معرفی این نشریه در پلت‌فرم اینستاگرام شاخه دانشجویی انجمن بین‌الملی زیست محاسباتی را مطالعه کنید.


🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

❤️ خرسندیم که بار دیگر در کنار شما بودیم
💡 دورهمی علمی پاییزه
🎙 همراه با سخنرانی جناب آقای دکتر میلاد غفوری با موضوع آیا طراحی دارو از بیوانفورماتیک فاصله گرفته است؟

🗓 پنجشنبه ۱۹ام مهر ماه ۱۴۰۳
📍 سرای محله قیطریه

🚀 Telegram
🖼 LinkedIn
📱 Instagram

❤️ پس از برگزاری موفقیت آمیز دو سری کارگاه حضوری و آنلاین در تابستان ۱۴۰۲ با موضوع:
✅طراحی پروتئین با تدریس سرکار خانم  دکتر فاطمه فروتن و
✅ آشنایی و جست‌وجو در محیط لینوکس با تدریس جناب آقای دکتر رضا کربلایی.

✨ این بار در پاییز ۱۴۰۲ شاخه دانشجویی انجمن جهانی زیست‌‌شناسی محاسباتی آماده‌‌است تا در کارگاه  Single-cell RNA-seq ( ۳جلسه‌ تدریس و یک جلسه پرسش و پاسخ) مهارت‌های شما را به سطح بالاتری در حوزه بیوانفورماتیک و زیست‌ محاسباتی ببرد.

🙂 شما می‌توانید بخشی از نظرات شرکت‌کنندگان‌ دو سری کارگاه قبلی را در یک ویدئو ۶۰ ثانیه‌ای ببنید.




🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

⚠️اطلاعیه مهم برای شرکت‌کنندگان حضوری ایونت CB TALK

همراهان عزیز،
به اطلاع شما می‌رسانیم که برای ورود به ایونت CB TALK، لطفاً از درب مشخص شده در تصویر پیوست استفاده کنید. محل برگزاری این رویداد در سالن 17 شهریور، دانشکده زمین قرار دارد.

این نکته را مد نظر داشته باشید تا از هرگونه سردرگمی جلوگیری شود و به راحتی به محل ایونت دسترسی پیدا کنید.

با تشکر از همراهی شما و امیدواریم لحظات خوبی را در این ایونت سپری کنید!

RSG - Iran pinned «⚠️همراهان عزیز RSGIran توجه فرمایید: برگزاری ششمین جلسه از سلسه جلسات CB TALK، در ساختمان پروین اعتصامی، سالن دانشکده‌ی علوم زمین برگزار خواهد شد. 📍آدرس دقیق محل برگزاری : تهران، خیابان مفتح، نرسیده به دروازه دولت، دانشگاه خوارزمی، ساختمان دانشکده‌ی علوم…»

⚠️همراهان عزیز RSGIran توجه فرمایید:

برگزاری ششمین جلسه از سلسه جلسات CB TALK، در ساختمان پروین اعتصامی، سالن دانشکده‌ی علوم زمین برگزار خواهد شد.

📍آدرس دقیق محل برگزاری :
تهران، خیابان مفتح، نرسیده به دروازه دولت، دانشگاه خوارزمی، ساختمان دانشکده‌ی علوم زمین

و دقت بفرمایید:
🖥چنانچه قصد شرکت در این جلسه را دارید، تنها تا ساعت 20:00 امشب فرصت باقی است.

☄️ سرطان دیگر یک بیماری ناشناخته و پیچیده نیست!

📈با پیشرفت‌ در علم، اکنون در مسیری هستیم که می‌توانیم نقشه ژنتیکی تومورها را دقیق‌تر از همیشه
رمزگشایی کنیم.
✔️اما باید توجه داشت با حجم عظیم داده‌های ژنتیکی و بالینی که در اختیار محققان است، توانایی تحلیل و درک این داده‌ها بدون استفاده از الگوریتم‌ها و ابزارهای محاسباتی تقریبا غیرممکن است.

❓ در ششمین cb talk، به بررسی ضرورت استفاده از زیست‌شناسی محاسباتی در تحقیقات سرطان خواهیم پرداخت و به شما نشان خواهیم داد که چگونه این رویکرد نوآورانه می‌تواند مسیر جدیدی در درمان سرطان ایجاد کند.

📣با سخنرانان ششمین cb talk بیشتر آشنا شوید:

💡 دکتر حسام منتظری، استادیار بیوانفورماتیک ibb، بر مدل‌های آماری و یادگیری ماشین در کشف ژن‌های سرطان‌زا و شناسایی ارتباطات سلولی در سرطان تمرکز دارد.
✅ در این سخنرانی، دکتر منتظری به بررسی روش‌های محاسباتی برای شناسایی عوامل محرک سرطان می‌پردازد. او با استفاده از یادگیری ماشین و مدل‌های ژنتیکی پیشرفته، ابزارهایی را معرفی می‌کند که می‌توانند ژن‌های دخیل در ایجاد سرطان را شناسایی کند.

💡دکتر محبوبه ضرابی، دانشیار گروه بیوتکنولوژی دانشگاه الزهرا، بر استفاده از بیوانفورماتیک ساختاری برای مطالعه پروتئین‌ها و تعاملات مولکولی در سرطان تمرکز دارد و به بررسی ساختارهای پروتئینی برای بهبود درمان‌های هدفمند سرطان می‌پردازد.
در این سخنرانی دکتر ضرابی به روش های استفاده از بیوانفورماتیک ساختاری برای بررسی تعاملات مولکولی در سرطان می‌پردازد.

💬 در این cb talk که به‌صورت هیبرید  برگزار می‌شود منتظر حضور شما هستیم؛
🔴آنلاین: در بستر اسکای روم
🔴حضوری: در سالن ۱۷ شهریور دانشگاه خوارزمی

🔗 ثبت‌نام حضوری و آنلاین در این برنامه از طریق سایت رایازی قابل ثبت است.

🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

💥 دانش، چاره است.
به‌بهانه‌ی نوبل امسال، سری به جایزه نوبل سال گذشته زدیم

🗓 در زمان همه‌گیری کرونا، نحوه‌ی واکنش دانشمندان نسبت به ویروسی که آن را مطالعه می‌کردند، کمتر مرموز و مطمئنا قابل‌پیش‌بینی‌تر بود.

🎮 آن‌ها در آزمایشگاه‌های خود در شرایط سختی کار می‌کردند و نتایج درخشانی را به بار آوردند. یکی از آن نتایج، توسعه‌ی ساخت واکسن بر پایه‌ی mRNA بود که جایزه‌ی نوبل پزشکی سال ۲۰۲۳ را برای Katalin Kariko و Drew Weissman به همراه داشت.

🛡 در mRNA طبیعی، نوکلئوزید یوریدین اغلب توسط سیستم ایمنی به عنوان نشانه‌ای از RNA ویروسی شناخته می‌شود که منجر به واکنش‌های التهابی می‌شود.

😮 برای جلوگیری از این موضوع، کاریکو و وایزمن، یوریدین را با یک باز اصلاح‌شده، مانند سودویوریدین، جایگزین کردند. این باز تغییریافته، شبیه به یوریدین است؛ اما، واکنش ایمنی مضر را ایجاد نمی‌کند.

👍 با استفاده از این بازهای اصلاح‌شده، mRNA می‌تواند به طور موقت از شناسایی توسط سیستم ایمنی ذاتی فرار کند تا به پروتئین مورد نظر (مانند پروتئین اسپایک در واکسن‌های COVID-19) ترجمه شود و واکنش ایمنی را بدون ایجاد التهاب مضر تحریک کند.

➕ این بازهای اصلاح‌شده همچنین پایداری و کارایی mRNA را بهبود می‌بخشند و اطمینان می‌دهند که پروتئین به طور مؤثری تولید می‌شود.

📌 در حال حاضر، این فناوری mRNA، امکانات جدیدی را برای توسعه‌ی واکسن علیه آنفولانزا، HIV و حتی درمان سرطان ایجاد کرده است.

👀 برای اطلاعات بیشتر، ویدئوی همراه با پست را مشاهده کنید.

🔜 منتظر ویدئوی نوبل امسال هم باشید.

❤️ گردآورنده: آی‌ســـان نـقــابــی

📱 Telegram
📱 LinkedIn
📱 Instagram

▶️ در حال برگزاری
برای شرکت در 4️⃣2️⃣ ژورنال کلاب با موضوع بررسی کتاب fundamentals of bioinformatics and computational biology می‌توانید از لینک درج شده اقدام کنید.
🔗https://vc.sharif.edu/sharifi

💬 شب امتحان وقتی هرچی یه موضوع رو میخونی متوجه نمیشی، چی به دردت میخوره؟

زمان مدرسه، دوستامون یا معلم خصوصی به دادمون میرسیدند تا بخش‌هایی از کتاب یا جزوه رو که نمی‌فهمیدیم برامون توضیح بدهند.

اما الان دیگه از این خبرا نیست!
پای تحقیق و پژوهش و کتاب‌های مرجع وسطه!

خب کی قراره کمک کنه؟ 🥲

💡وقتی کتاب‌های علمی هر روز دارند آپدیت میشن کدوم معلم به همه‌شون مسلطه؟!!

🔍 گوگل یه سرویس ارائه کرده به اسم Notebook LM که هوش از سرتون می‌پره 🫦 اگه بدونید چه کارهایی انجام میده!

یه نوت‌بوک براتون میسازه! شما کتاب و جزوات مختلف رو توش آپلود میکنید! بعد ازش راجع به این فایل‌هایی که آپلود کردید سوال می‌پرسید!
و نکته‌ی مهم اینجاست که جواب سوالات شما رو بر اساس منابعی که خودتون آپلود کردید میده! نه بر اساس استنتاج خودش که شاید در خیلی از مواقع اشتباه باشه!

میدونم بعضی‌هاتون هنوز chatGPT premium رو استفاده نکردید چون واقعا گرونه!
اما خبر خوب اینه که این یکی رایگانه! 💥

🔗خب پس چرا اینجا کلیک نمی‌کنی و تستش کنی؟


گردآورنده: مصطفی شاه‌حسینی


🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

🔜 سرفصل‌های کارگاه  Single Cell RNA Seq

🗓 سومین کارگاه شاخه دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران با موضوع Single Cell RNA Seq در ۴ جلسه به‌صورت حضوری و آنلاین در تاریخ‌های ۳۰ مهر ماه ۱، ۵ و ۱۵ام آبان ماه برگزار می‌شود که سرفصل‌های این کارگاه ۴ جلسه‌ای را در دو فایل پیوست می‌توانید ببینید.

🖥 برای کسب اطلاعات بیشتر درباره‌ی کارگاه به پست معرفی کارگاه مراجعه کنید

🔗لینک ثبت‌نام کارگاه به‌صورت حضوری و آنلاین
🔗لینک ثبت‌نام کارگاه به‌صورت آنلاین

✉️ در صورت داشتن هر گونه سوال به اکانت پشتیانی انجمن زیست محاسباتی  به آیدی @RSG_Iran مراجعه کنید.

📎 یادگیری ماشینی (ML) با ارائه ابزارهای قدرتمند برای:
📌پردازش
📌تجزیه و تحلیل
📌و درک مجموعه داده های عظیم، زیست شناسی را متحول می‌‌کند.

💥 اهمیت یادگیری ML در زیست‌شناسی در چندین زمینه کلیدی نهفته است:
1. مدیریت کلان داده‌ها
2. انجام پیش بینی
3. اتوماسیون

برای آشنایی با یادگیری ماشینی در زیست‌شناسی چه موضوعاتی را باید یاد گرفت؟

1. زیست شناسی پایه: مفاهیم کلیدی مانند: DNA، RNA، پروتئین ها، بیان ژن و درک عملکرد سلول

2. مبانی یادگیری ماشین:
    - یادگیری تحت نظارت
    - یادگیری بدون نظارت
    - یادگیری عمیق

3. مهارت‌های برنامه نویسی: یادگیری کدنویسی به زبان‌هایی مانند پایتون یا R که به‌طور معمول برای تجزیه و تحلیل داده‌ها و یادگیری ماشین در زیست‌شناسی استفاده می‌شوند. آشنایی با کتابخانه‌هایی مانند TensorFlow، scikit-learn یا BioPython

4. مدیریت و ترسیم داده‌ها: درک نحوه مدیریت و ترسیم مجموعه داده‌های بیولوژیکی.

توالی یابی RNA تک سلولی (scRNA-seq) چیست؟
توالی یابی RNA تک سلولی (scRNA-seq) تکنیکی است که برای مطالعه بیان ژن تک تک سلول.ها استفاده می‌شود. به جای تجزیه و تحلیل گروهی از سلول‌ها با هم (توالی RNA حجیم)، scRNA-seq تصویری از آنچه هر سلول جداگانه انجام می‌دهد از نظر این که کدام ژن در یک لحظه معین بیان می‌شوند ارائه می‌دهد.
این روش زیست شناسی را متحول کرده است زیرا؛ تنوع را در یک جمعیت سلولی آشکار می‌کند و تفاوت‌های ظریف بین سلول‌ها را شناسایی می‌کند که در غیر این صورت پنهان می‌شدند.

💱 ارتباط بین یادگیری ماشین و scRNA-seq
ارتباط بین scRNA-seq و یادگیری ماشین بسیار مهم است زیرا scRNA-seq مجموعه داده‌های بزرگ و پیچیده‌ای را تولید می‌کند که نیاز به تجزیه و تحلیل پیچیده دارد.  یادگیری ماشینی به روش‌های زیر کمک می کند:

1. کاهش ابعاد: داده‌های scRNA-seq حاوی هزاران سطح بیان ژن در هر سلول است که داده ها را بسیار پیچیده می کند. 
2. خوشه‌بندی سلول‌ها
3. شناسایی نوع سلول
4. پیش‌بینی رفتار سلولی

برای آشنایی با scRNA-seq چه موضوع‌هایی را باید یاد گرفت؟
1. بیولوژی سلولی پایه
2. تکنیک‌های scRNA-seq
3. پردازش و تجزیه و تحلیل داده‌ها

4. یادگیری ماشین برای scRNA-seq:
    - کاهش ابعاد
    - الگوریتم‌های خوشه‌بندی
    - مدل‌های طبقه‌بندی


🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram